Différences
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| Ligne 10: | Ligne 10: | ||
| Expert analyse numérique et calcul scientifique : Cerasela Calugaru \\ | Expert analyse numérique et calcul scientifique : Cerasela Calugaru \\ | ||
| [[https://moonimpact.eu/home/|Website of the project]] | [[https://moonimpact.eu/home/|Website of the project]] | ||
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| ====== Contribution of CBP/PSMN ====== | ====== Contribution of CBP/PSMN ====== | ||
| + | Dans le cadre de ce projet, le CBP apporte une expertise et soutien en informatique et calcul scientifique notamment pour le portage, déboggage et l’optimisation de codes (dont ABINIT, VASP et CALYPSO) et des exécutions intensives sur les plateformes de calcul : | ||
| - | * un soutien à l’installation et la mise à jours des codes utilisés pas les chercheurs (dont ABINIT), à l’optimisation des environnements d’exécution (compilateurs et bibliothèques, scripts batch, queues de soumission, …) et aux questions de nature numérique (schéma numériques, algorithmes) | + | * Installation du code CALYPSO, la rédaction des instructions d’utilisation, aide au couplage avec le logiciel VASP et mise en place d’un programme de recherche de l’origine de divers problèmes |
| + | * Vérification des options d’exécution MPI pour le code ABINIT, notamment les protocoles de communication inter-processus, l'export de variable d’environnement, le fichier hostfile | ||
| + | * Explication de la stratégie et mise en oeuvre d’une procédure de soumission manuelle et automatique pour l’exécution d’une enchainement particulier de simulations, puis déboggage de son script pour l’intégration d’une partie en langage PERL. | ||
| + | * Assistance à l’utilisation de VASP sur le scratch des serveur de calcul | ||
| + | * Initiation à l’utilisation en ligne de commande du système de versionning git; information sur les diverses formations git déjà proposées au niveau local par d’autres formateurs | ||
| + | * Aide au montage d’un ensemble matériel pour la VR (Virtual Reality), à la configuration logiciel et aux tests de fonctionnement | ||
| + | * Installation optimisée de la version ABINIT 8.10.3 et tests de fonctionnement | ||
| + | * Mise en place d’une solution de visualisation des hologrammes : étude des diverses pistes (dont anaconda et pip) pour la définition d’un environnement Python pour installation et le bon fonctionnement du paquet Open3D ; analyse d’un ensemble de scripts Python / IDL et d’autres fichiers issus de l’utilisation d’une équipe américaine (travail à continuer) | ||
| + | * Installation d’un couplage du logiciel LAMMPS_3Mar20-quip-gap avec l'instalation de librairies GAP et QUIP (et ASE) | ||
| + | * Expertise pour une erreur survenue pour le postprocessing "anaddb" de la version ABINIT 8.10.3 | ||
| + | * Installation optimisée de la version ABINIT 9.4.1 avec l'instalation de librairies HDF5, NetCDF, LibXC et tests de fonctionnement | ||