Support et recherche en calcul scientifique

Cerasela Iliana CALUGARU
Centre Blaise Pascal
École normale supérieure de Lyon
Ingénieur de Recherche en Calcul Scientifique
Docteur en Mathématiques Appliquées
Courriel : Cerasela.Iliana.Calugaru @ ens-lyon.fr |
Téléphone : (+33) 4 72 72 86 31

Dans le cadre de projets de recherche, j’apporte une expertise dans l’utilisation des méthodes mathématiques et des moyens informatiques pour résoudre un problème théorique ou une situation d’expérience et d’observation.

En fonction des besoins du projet, je suis amenée à m’investir dans l’activité de recherche du domaine scientifique concerné et dans les activités informatiques associées avec un équilibre variable entre les deux.

Competences

  • Discrétisation EDP (les méthodes de FD, FE, FV)
  • Algorithmes numériques pour la résolution de systèmes linéaires & non linéaires
  • Algorithmes numériques pour des problèmes inverses
  • Développement, parallélisation et optimisation de codes de calcul

Activités au Centre Blaise Pascal

Soutien à la recherche / Recherche

Ces activités consistent à formaliser ou aider un chercheur à formaliser un problème scientifique, pour sa modélisation, sa représentation, et son traitement.

Projets de recherche :

  • Dissipation des courants océaniques par radiation d'ondes internes : Dissipation des courants océaniques par radiation d'ondes internes : Les fluides stratifiés en densité permettent la propagation d'ondes de gravité aux propriétés étonnantes. Le passage de courants océaniques au dessus de fonds marins ondulés peut générer de telles ondes, qui modifient en retour les courants et la stratification ambiante. Le but du projet est d'estimer les transferts d'énergie et de moment entre ondes et courants moyens. Nous combinons approches théoriques et expériences numériques réalisées avec le MIT-GCM dans des configurations idéalisées. (Laboratoire de Physique, 2016 – 2020)
  • Manteau et océans de magma : Convection dans le manteau et océans de magma : dans ce travail on s'intéresse à l'implémentation de conditions limites de fusion et cristallisation dans le code de convection dans le manteau StagYY (Paul Tackley). La théorie concernant les conditions limite est celle développée par Alboussière et Deguen pour la convection dans la graine. (Laboratoire de Géologie de Lyon, 2015 – 2018)
  • Dynamique moléculaire : Projet ANR FSCFCode AquaSol (Laboratoire de Physique, 2012 – 2015)
  • Biologie cellulaire : Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images, Projet de développement d’une bibliothèque en C++, sa parallélisation et intégration dans des logiciels libres (+ projet master) (Laboratoire de Reproduction et Développement des Plante, 2013 – 2016)
  • Ecoulements turbulents bidimensionnels et géophysiques : Equation barotrope stochastique 2D : optimisation et validation quantitative du code en définissant un jeu de tests et des cas de référence pour vérifier l’aptitude du code à approximer les divers termes intervenant dans l’équation. (Laboratoire de Physique, 2014 – 2016)
  • Mécanique de fluides : Logiciel de simulation 3D des phénomènes d'écoulement et de transport - Code SoFTP. Projet de développement logiciel (Centre Blaise Pascal)
  • Turbulence : Code IncNS - portage du code sur des architectures GPU, (Laboratoire de Physique, 2012 – 2013)
  • Géophysique : méthode d’ordre élevé pour le calcul de l’énergie dans le code ABINIT dans le cadre du projet WURM (Laboratoire de Géologie, 2012 – 2014) – aide ponctuel

En fonction des objectifs du projet, je suis amenée à :

  • Concevoir, développer ou adapter des méthodes d’analyse : calcul numérique, statistique, traitement du signal, traitement d’images, modélisation, etc.
  • Choisir les moyens logiciels et matériels, en tenant compte de leurs performances et de leur pertinence dans le cadre d’un problème donné ou d’un projet de recherche
  • Assurer l’organisation des données et le suivi de leur exploitation jusqu’à leur visualisation
  • Assurer une veille technologique sur l’évolution des architectures matérielles, des systèmes, et des concepts associés
  • Assurer une veille scientifique sur l’évolution des concepts et des méthodes dans les domaines d’application
  • Aider les chercheurs dans le choix et dans l’implémentions des méthodes numériques, dans l’utilisation des bibliothèques de calcul et dans la mise en oeuvre des techniques de programmation, de parallélisation et d’optimisation
  • Développer, paralléliser et optimiser de codes de calcul
  • Choisir, acquérir, et exploiter des calculateurs haute performance
  • Diffuser et valoriser les méthodes et outils développés

Formation

Animation scientifique

  • Conception, mise à jour et maintenance de sites web : serveur Web et Site Internet du CBP (2009, jusqu'à avril 2013 ); site Internet du PSMN (2009 -…); serveur Web et Site Internet du CFCAM-RA (2011- jusqu'à juin 2013); mini-Site Internet pour des workshops et formations (2009, jusqu'à avril 2013)
  • Co-organiser ou participer à l'organisation des manifestations scientifiques :
  • Représenter le Centre Blaise Pascal auprès de différents publics (réunions de travail, manifestations scientifiques)
  • Gestion de la liste de diffusion du Centre Blaise Pascal (2009 -…)
  • S’impliquer dans des réseaux de compétence : GDR Calcul, représentant du Centre Blaise Pascal dans le Réseau LyonCalcul, etc .

Activités au PSMN

Participation à la gestion et à l’exploitation de machines de calcul

  • Installations et tests sur les serveurs du PSMN : installations optimisées et tests de fonctionnement et performance logiciels ( par exemple, cp2k avec intel/MKL avec fft de MKL,Lammps, …), tests d’utilisation de compilateurs (gnu, intel, tests de fonctionnement et performance pgi), des bibliothèques (ex. PETSc, FFTW,Blitz, …) benchmarks GPU
  • Participer à la création/suppression de comptes utilisateur sur les serveurs du PSMN
  • Participer au suivi du bon fonctionnement de noeuds de calcul sur les serveurs du PSMN
  • Participer au suivi de quota disque sur les serveurs du PSMN

Formations sur des outils du calcul scientifique et utilisation de machines PSMN

Il s’agit principalement des formations pour les nouveaux utilisateurs ou des formations personnalisées : mise à niveaux Linux, présentation des serveurs, connexion, environnement logiciel, compilation séquentielle/parallèle, configuration de queues, scripts de soumission et contrôle de jobs séquentiels/parallèles.

Expertise et Support en calcul scientifique

  • Expertise au choix de méthodes numériques
  • Expertise et Support au choix et à l’utilisation d’outils de calcul

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Centre Blaise Pascal, Maison de la modélisation de Lyon, Maison de la simulation de Lyon, Hôtel à projets

ressources/calcul.txt · Dernière modification: 2017/05/18 15:21 par cicaluga