Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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developpement:activites:integration:vmd4dwheezy [2013/05/14 09:02]
equemene [Compilation et installation de VMD version OpenCL]
developpement:activites:integration:vmd4dwheezy [2015/01/07 10:04] (Version actuelle)
Ligne 153: Ligne 153:
 mv strideLINUX stride_LINUX mv strideLINUX stride_LINUX
 cd ../.. cd ../..
-ogramme ​ 
-make install 
 # Changement de la version de librairie pour Python # Changement de la version de librairie pour Python
 sed -i "​s/​python2\.5/​python2\.7/​g"​ configure sed -i "​s/​python2\.5/​python2\.7/​g"​ configure
Ligne 177: Ligne 175:
 </​code>​ </​code>​
  
 +Une commande utile, dans l'​environnement SIDUS, pour que VMD soit fonctionnel :<​code>​
 +sed -i "​s/​-b(){}\[\],&​^%#;​|\\\\\\\//​g"​ /​usr/​local/​bin/​$VMDINSTALLNAME
 +</​code>​
 ==== Compilation et installation de VMD version CUDA ==== ==== Compilation et installation de VMD version CUDA ====
  
Ligne 266: Ligne 267:
 ln -s $VMDINSTALLNAME vmd ln -s $VMDINSTALLNAME vmd
 </​code>​ </​code>​
 +
 +
 +http://​www.ks.uiuc.edu/​Research/​vmd/​mailing_list/​vmd-l/​19158.html
  
 ==== Installation dans l'​environnement Gnome ==== ==== Installation dans l'​environnement Gnome ====
Ligne 271: Ligne 275:
 Par défaut, la Debian Wheezy propose Gnome Unity. Par défaut, la Debian Wheezy propose Gnome Unity.
  
-Pour installer une icône ​+Pour installer une icône ​directement dans le dossier Science, voici la commande pour créer manuellement cette entrée : 
 +<​code>​ 
 +tee /​usr/​share/​applications/​VMD.desktop <<​EOF 
 +[Desktop Entry] 
 +Version=1.0 
 +Encoding=UTF-8 
 +Name=VMD 
 +GenericName=VMD 
 +Comment=Visual Molecular Dynamics (not Open Source one :-( ) 
 +Exec=/​usr/​local/​bin/​vmd 
 +Icon=/​opt/​vmd/​plugins/​noarch/​tcl/​molefacture1.3/​lib/​nucleic_acids/​dna_dihedrals.gif 
 +Type=Application 
 +Terminal=true 
 +Categories=Science;​Education;​Chemistry,​Biology;​ 
 +EOF 
 +</​code>​ 
 + 
  --- //​[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2013/03/21 10:20//  --- //​[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2013/03/21 10:20//
developpement/activites/integration/vmd4dwheezy.1368514965.txt.gz · Dernière modification: 2015/01/07 10:04 (modification externe)