Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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developpement:activites:integration:vmd4dwheezy [2013/05/14 08:49] equemene |
developpement:activites:integration:vmd4dwheezy [2015/01/07 10:04] (Version actuelle) |
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Ligne 153: | Ligne 153: | ||
mv strideLINUX stride_LINUX | mv strideLINUX stride_LINUX | ||
cd ../.. | cd ../.. | ||
- | ogramme | ||
- | make install | ||
# Changement de la version de librairie pour Python | # Changement de la version de librairie pour Python | ||
sed -i "s/python2\.5/python2\.7/g" configure | sed -i "s/python2\.5/python2\.7/g" configure | ||
Ligne 177: | Ligne 175: | ||
</code> | </code> | ||
+ | Une commande utile, dans l'environnement SIDUS, pour que VMD soit fonctionnel :<code> | ||
+ | sed -i "s/-b(){}\[\],&^%#;|\\\\\\\//g" /usr/local/bin/$VMDINSTALLNAME | ||
+ | </code> | ||
==== Compilation et installation de VMD version CUDA ==== | ==== Compilation et installation de VMD version CUDA ==== | ||
Ligne 265: | Ligne 266: | ||
cd /usr/local/bin | cd /usr/local/bin | ||
ln -s $VMDINSTALLNAME vmd | ln -s $VMDINSTALLNAME vmd | ||
+ | </code> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/mailing_list/vmd-l/19158.html | ||
+ | |||
+ | ==== Installation dans l'environnement Gnome ==== | ||
+ | |||
+ | Par défaut, la Debian Wheezy propose Gnome Unity. | ||
+ | |||
+ | Pour installer une icône directement dans le dossier Science, voici la commande pour créer manuellement cette entrée : | ||
+ | <code> | ||
+ | tee /usr/share/applications/VMD.desktop <<EOF | ||
+ | [Desktop Entry] | ||
+ | Version=1.0 | ||
+ | Encoding=UTF-8 | ||
+ | Name=VMD | ||
+ | GenericName=VMD | ||
+ | Comment=Visual Molecular Dynamics (not Open Source one :-( ) | ||
+ | Exec=/usr/local/bin/vmd | ||
+ | Icon=/opt/vmd/plugins/noarch/tcl/molefacture1.3/lib/nucleic_acids/dna_dihedrals.gif | ||
+ | Type=Application | ||
+ | Terminal=true | ||
+ | Categories=Science;Education;Chemistry,Biology; | ||
+ | EOF | ||
</code> | </code> | ||
--- //[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2013/03/21 10:20// | --- //[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2013/03/21 10:20// |