developpement:activites:integration:lammpsgpu4wheezy

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement:activites:integration:lammpsgpu4wheezy [2013/11/07 14:50]
equemene [Compilation avec FFTW et OpenMPI]
+++ developpement:activites:integration:lammpsgpu4wheezy [2015/01/07 10:04] (Version actuelle)
@@ Ligne 69: / Ligne 69: @@
 ln -s Makefile.lammps.gfortran Makefile.lammps </code>
   - Compilation de la librairie AWPMD<code>cd $LAMMPSROOT/lib/awpmd
+sed -i "s/mpic++/mpic++.openmpi/g" Makefile.openmpi
 make -f Makefile.openmpi clean
 make -f Makefile.openmpi
@@ Ligne 163: / Ligne 164: @@
 <code>cd $LAMMPSROOT/src/MAKE
 cp Makefile.serial Makefile.cuda_fftw
-sed -i "s/FFT_INC\ =/FFT_INC\ =\ -DFFT_FFTW3/g" Makefile.fftw
+sed -i "s/FFT_INC\ =/FFT_INC\ =\ -DFFT_FFTW3/g" Makefile.cuda_fftw
-sed -i "s/FFT_LIB\ =/FFT_LIB\ =\ -lfftw3/g" Makefile.fftw
+sed -i "s/FFT_LIB\ =/FFT_LIB\ =\ -lfftw3/g" Makefile.cuda_fftw
 cd $LAMMPSROOT/src
 make yes-asphere
@@ Ligne 196: / Ligne 197: @@
 sed -i "s/g++/mpic++.openmpi/g" Makefile.mpic++
 sed -i "s/\-fpermissive/-fpermissive\ \-DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK/g" Makefile.mpic++
 make -f Makefile.mpic++ clean
 make -f Makefile.mpic++
@@ Ligne 202: / Ligne 202: @@
 === Préparation du Makefile pour GPU ===
+La librairie GPU doit être compilée en fonction du GPU à disposition : Nvidia fournit un tableau dans sa [[https://www.clear.rice.edu/comp422/resources/cuda/html/cuda-compiler-driver-nvcc/index.html|documentation]] permettant de choisir en fonction de sa carte. Le fichier à modifier est ''$LAMMPSROOT/lib/gpu/Makefile.linux''.
+Ce qu'il faut retenir :
+  * Pour une carte Tesla
+    * sm_10 : basique
+    * sm_11 : opérations atomiques en mémoire globale
+    * sm_12 : opérations atomiques en mémoire partagée
+    * sm_13 : support de la double précision
+  * Pour une carte Fermi :
+    * sm_20
+    * sm_21
+  * Pour une carte Kepler :
+    * sm_30
+    * sm_35
+Par exemple, une carte GTX Titan est équipé d'un circuit Kepler. Nous avons donc :<code>CUDA_ARCH = -arch=sm_30
+</code>
 Si les composants sont ceux des paquets Debian Wheezy, bindés dans ''/tmp/cuda''
 <code>
 cd $LAMMPSROOT/lib/gpu
+# Modification de la racine de CUDA
 sed -i 's/^CUDA_HOME/CUDA_HOME\ = \/tmp\/cuda\n#CUDA_HOME/g' Makefile.linux
+# Modification de l'architecture (ici une Kepler)
+sed -i 's/^CUDA_ARCH/# Kepler CUDA\nCUDA_ARCH\ =\ \-arch\=sm_30\n#CUDA_ARCH/g' Makefile.linux
+# Modification du compilateur mpic++ (force a OpenMPI)
+sed -i "s/mpic++/mpic++.openmpi/g" Makefile.linux
 make -f Makefile.linux clean
-make -f Makefile.linux
+make -j 4 -f Makefile.linux
 ./nvc_get_devices
 </code>
@@ Ligne 216: / Ligne 239: @@
 <code>cd $LAMMPSROOT/src/MAKE
 cp Makefile.openmpi Makefile.cuda_openmpi
-sed -i "s/FFT_INC\ =/FFT_INC\ =\ -DFFT_FFTW3/g" Makefile.fftw
+sed -i "s/mpic++/mpic++.openmpi/g" Makefile.cuda_openmpi
-sed -i "s/FFT_LIB\ =/FFT_LIB\ =\ -lfftw3/g" Makefile.fftw
+sed -i "s/FFT_INC\ =/FFT_INC\ =\ -DFFT_FFTW3/g" Makefile.cuda_openmpi
+sed -i "s/FFT_LIB\ =/FFT_LIB\ =\ -lfftw3/g" Makefile.cuda_openmpi
 cd $LAMMPSROOT/src
 make yes-asphere
@@ Ligne 227: / Ligne 251: @@
 <code>cd $LAMMPSROOT/src
-make cuda_openmpi</code>
+make -j 4 cuda_openmpi</code>
 Si la compilation est réussie, un exécutable ''lmp_cuda_openmpi'', se trouve à la racine du dossier.

developpement/activites/integration/lammpsgpu4wheezy.1383832247.txt.gz · Dernière modification: 2015/01/07 10:04 (modification externe)

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