Installation de CPMD sous Debian Jessie

Le téléchargement du source exige un identifiant/mot de passe. La dernière version d'archive accessible est la 3.17.1.

cd /opt
tar xzf /root/cpmd-v3_17_1.tar.gz
mv CPMD CPMD-3.17.1
ln -s CPMD-3.17.1 CPMD


chmod 755 .

Pour son utilisation, vous pouvez consulter le "pied à l'étrier" rédigé pour les applications scientifiques installées dans le cadre de la formation Atosim.

Par défaut, le source de Gaussian comprend les résultats de tests sur architecture AMD64 dans le dossier $g09root/g09/tests/amd64.

Pour exécuter tous les tests, voici la commande

# Creation du dossier pour tous les jobs
mkdir -p /local/$USER/Gaussian/tmp

# A rajouter à la fin de son .bashrc
export g09root=/opt
export GAUSS_SCRDIR=/local/$USER/Gaussian/tmp
. $g09root/g09/bsd/g09.profile

Lancement de tous les tests :

cd /local/$USER/Gaussian
cp $g09root/g09/tests/com/test*[0-9][0-9].com /local/$USER/Gaussian
for i in $(seq 0 1 1044)
do
  if [ -f test$(printf "%04d" $i).com ]; then
     { /usr/bin/time g09 test$(printf "%04d" $i).com ; } 2> test$(printf "%04d" $i).time
  fi
done

Pour établir les patchs à appliquer par rapport à l'archive de sources originelle, la commande suivante a été utilisée :

diff -crB g09 g09.work > g09.jessie64

— Emmanuel Quemener 2015/03/23 09:50