Support et recherche en informatique scientifique
Emmanuel QUEMENER
Centre Blaise Pascal
École normale supérieure de Lyon
Ingénieur de Recherche - Pilote d’essais informatiques
Courriel : Emmanuel.Quemener @ ens-lyon.fr
Téléphone : (+33) 4 72 72 86 33
Contact pour :
- exploitation des plateaux techniques en service du CBP
- librification de codes scientifiques
- conception, déploiement et administration de nouveaux plateaux techniques ;
- expertise pour résoudre un problème en informatique scientifique ;
- qualification de logiciels et matériels (banc d'essai en calcul scientifique).
L'informatique scientifique exige une polyvalence accrue. Les missions et les activités suivantes sont issues de REFERENS :
Activités principales
- Spécification des architectures matérielles et logicielles en prenant en compte les besoins des partenaires
- Conception et mise en oeuvre des codes scientifiques, services, systèmes, réseaux et télécommunications
- Définition des moyens et les procédures pour garantir les performances et la disponibilité des systèmes informatiques
- Aide au chercheur à formaliser un problème scientifique, pour sa modélisation, sa représentation, et son traitement
- Conception, développement ou adaptation des méthodes d’analyse ou de codes existants : calcul numérique, statistique, traitement du signal, traitement d’images, modélisation …
- Organisation des données et suivi de leur exploitation jusqu’à leur visualisation
- Gestion de projet technique pour la résolution d’une problématique scientifique dans toutes ses dimensions
Activités associées
- Veille technologique polyvalente avec expérimentation
- Intervention en qualité d’expert dans des groupes de travail externes
- Participation à l’organisation et à l’animation de réseaux métiers
- Former et assurer le transfert des connaissances et des savoir-faire
- Participation à la formation des utilisateurs du calcul numérique intensif, diffuser et valoriser les méthodes et outils développés
- Choix, à l’acquisition, et à l’exploitation des calculateurs haute performance
- Représenter son organisme auprès de différents publics nationaux ou internationaux
Projets réalisés
- Migration de l'infrastructure du Cecam France sur architecture virtualisée sous Xen (2009Q4)
- Conception, mise en place et administration de plateaux techniques informatiques :
- pour le calcul parallèle multi-noeuds : disposer de plus de 1000 coeurs pour jusqu'à 64 noeuds
- cluster de 64 noeuds 16-coeurs en IB FDR (2022Q3)
- cluster de 12 noeuds 96-coeurs en IB QDR (2021Q3)
- cluster de 64 noeuds octo-coeurs en IB QDR (2020Q4)
- cluster de 8 noeuds octo-coeurs en IB FDR (2018Q1)
- cluster de 4 noeuds bi-coeurs en IB SDR et 48 HD (2018Q1)
- cluster de 2 noeuds bi-coeurs en IB DDR (2018Q1)
- cluster de 2 noeuds mono-coeurs en IB SDR (2018Q1)
- cluster de 64 noeuds octo-coeurs en IB QDR (2015Q4)
- cluster de 48 noeuds octo-coeurs en IB QDR (2014Q1)
- cluster de 48 et 24 noeuds en IB (2013Q3)
- cluster de 12 noeuds mixtes quadri-processeur (2012Q2)
- cluster de 50 noeuds en IB à base de noeuds déclassés (2011Q3)
- cluster de 24 noeuds à base de noeuds déclassés du PSMN (2010Q1)
- cluster de 8 noeuds à base de stations de travail (2009Q4)
- pour le calcul parallèle multi-coeurs : disposer de 2 à 128 coeurs
- pour le calcul parallèle sur GPU : disposer du plus large panel
- pour les architectures “exotiques”
- pour les formations en environnement contraint
- pour le calcul “à la demande” : COMOD (Compute On My Own Device)
- pour les humanités numériques : plateau technique AHN
- pour le pôle de diffusion des savoirs : Envemedis (2013Q2)
- pour la visualisation scientifique :
- vidéoprojecteurs haute définition dont 2 à capacités 3D (2013Q4)
- station de travail/écran/vidéoprojecteur NVision 3D (2013Q4)
- pour les écoles des Houches Computational Physics
- éditions 2011, 2012, 2013, 2014, 2015 et 2016
Livrables, Communications, Formations, Articles
- Année 2023
- Présentation aux L3 Physique-Chimie des ressources du CBP
- Journée Immersion Cooling : Retour d'expérience
- Présentation sur l'Immersion Cooling à l'ENS-Lyon : Retour d'expérience
- Année 2022
- Présentation ASNUM 2022 : Portage d'un vieux code sur GPU
- Cours INSA Lyon M2 les GPU
- Cours INSA Lyon M2 les CPU
- Présentation JCAD 2022 Retour d'expérience sur l'immersion de serveurs
- Présentation aux L3 Physique-Chimie des ressources du CBP
- Cours 1 & 2 de ETSN 2022 au CIRM : Les GPU : technologie disruptive du 21e siècle
- Cours 3 de ETSN 2022 au CIRM : Portage d'un code et métrologie
- Cours 4 de ETSN 2022 au CIRM : Métrologie d'applications
- Cours 5 de ETSN 2022 au CIRM : Codes "Matrices"
- Présentation à Teratec 2022 : Préparation de machines et immersion de GPU
- Présentation sur l'Immersion Cooling à l'ENS-Lyon : Préparation de machines et immersion de GPU
- Année 2021
- Présentation ressources du CBP au département de biologie
- Présentation JCAD 2021
Digital Stagingou Digital re-* and de-* - Cours INSA Lyon 3ème année les GPU
- Cours INSA Lyon 3ème année les CPU
- Présentation CEA Parallélisation et Portage d'une application sur GPU
- Présentation ressources du CBP
- Fête de la science: Voyage au pays des ordinateurs
- Année 2020
- Présentation JoSy 2020 : SIDUS: outil diskless de reproductibilité présentation et vidéo
- Article LinkedIn AMBER : métrologie GPU
- Article LinkedIn Epyc Rome : la fin de l'hégémonie de la Nvidia V100 (ou d'Intel) ?
- Conférence au CRAL : Simuler un trou noir : de la parallélisation à la gépufication d'un (vieux) code
- TP pour l'INSA-Lyon en Master 2 : TP INSA 2019-2020 : le GPU par la pratique
- Année 2019
- Article LinkedIn Episode 3 - la GéPUfication d'un code pour simuler un trou noir
- Article LinkedIn Acte 2 - Simuler un trou noir : la parallélisation du code
- Article LinkedIn Simuler un trou noir : du processeur à la carte graphique
- TP pour l'INSA-Lyon en Master 2 : TP INSA 2019-2020 : le GPU par la pratique
- Cours à l'INSA-Lyon en Master 2 : Les GPU et leurs performances
- Présentation JRES 2019 sur Elapsed Time, pertinent pour la facturation ? : présentation, article et vidéo décembre 2019
- Présentation LIP : Autour des GPUs : Simuler un trou noir
- Présentation “Genome spatial organization modeling day” : Matrix codes
- Formation à l'usage du CBP : transparents
- Fête de la science: Voyage au pays des ordinateurs
- Journée thématique FLMSN & CBP “Le GPU par la pratique” avec son cours associé
- Conférence à ESDW 2019 : Benchmarking of GPU
- Citation dans Nucleic Acids Research, gkz374
- Citation dans Naville et al., 2019, Current Biology 29, 1161–1168
- Année 2018
- TP pour l'INSA-Lyon en Master 2 : Le GPU par la pratique
- Cours à l'INSA-Lyon en Master 2 : Les GPU et leurs performances
- Présentation à JCAD 2018 : HPDA@TheEdge
- Poster à JCAD 2018 : Le centre d'essais du CBP
- Fête de la science: Voyage au pays des ordinateurs
- Formation à l'usage du CBP : transparents
- Présentation aux étudiants de Licence ENS-Lyon : transparents
- Citation dans Plos One
- Citation dans Elsevier
- Citation dans Nature
- Cours à Journées GPGPU de LyonCalcul : Applications pour la physique & Analyse de performances
- Un CPU vs GPU : Les comparer par l'exemple vs GPU : Les comparer par l'exemple
- Présentation au club des développeurs de Lyon : Le GPU à l'épreuve de la métrologie
- Présentation au club des développeurs de Lyon : Disruptif or not disruptif : le GPU
- Année 2017
- Présentation aux Journées Succes 2017 : Installation Portail Galaxy
- Présentation aux 10emes journées Mésocentres : Métrologie comparée du PSMN & CBP
- Présentation au colloque HPC CEA/ENS-Cachan : présentation CBP et usage des GPU
- Ateliers 30 ans de l'ENS-Lyon, Atelier Voyage aux pays des ordinateurs
- Présentation aux étudiants de Licence ENS-Lyon : transparents
- Cours Astrosim 2017 : Pragmatic Parallelism and Introduction to GPU et Travaux pratiques GPU4dummies et para4dummies
- Club des décideurs HPE L’hétérogénéité des clusters de calcul : Hétérogénéité de l'hôtel à projets au méso-centre
- Année 2016
- Présentation Simulation Hub : Architectures multi-coeurs & myri-alus
- Présentation 9èmes Journées Méso-centres : Retour d'expérience GlusterFS
- Formation ISA 2016 (1 semaine) : SIDUS, de son exploitation locale à son déploiement sur cluster
- Présentation Grisbi 29 : SIDUS, une approche de la machine à discrétion
- Présentation ARAMIS 2016 : Stockage : des besoins aux outils
- Année 2015
- Présentation aux étudiants de Licence ENS-Lyon : transparents
- Présentation à MiniDebConf Lyon 2015 : SIDUS : a swiss knife for reproducibility
- Rapport la mise à disposition d'un portail Galaxy pour les laboratoires de biologie : Rapport 6 mois
- Année 2014
- Présentation à PyConFR 2014 : De la gestion de clusters à l'examen in silico des processeurs : la polyvalence de Python : Présentation (avec la partie la plus intéressante non évoquée)…
- Présentation à l'ISA
- Présentation au laboratoire de chimie : Parallelisme 4 Dummies
- Présentation au LIP sur SIDUS : presentation, janvier 2014
- Année 2013
- Présentation JRES 2013 sur Architectures mobiles et GPU : article, présentation et video décembre 2013
- Article Linux Journal sur SIDUS : novembre 2013
- Formation A la découverte du calcul : Performances de Codes
- Présentation SciPy 2013 sur SIDUS
- Citation dans ACS Nano, 2013, 7 (6), pp 5273–5281
- Présentation Aramis : Processeurs de mobile : le futur du HPC ?
- Année 2012
- Présentation Aramis : Virtualisation de ressources dans un contexte Open Source
- Présentation Séminaire Chimie Théorique ENS-Lyon : SIDUS & Loi d'Amdahl
- Présentation Ecole de Physique aux Houches : Ressources proposées
- Présentation Debian Facilitaties Days : From Workstations to HPC with Debian.
- Année 2011
- Présentation PyPhy 2011 : Multi-(cores|nodes|shaders) on Python for dummies
- Formation CIRA du 7/11 : Comment GPU faire cela ?
- Formation CIRA du 7/11 : Approche intégrateur
- JRES 2011 : le projet Distonet pour “Distributed Storage Network” article et présentation
- JRES 2011 : Stockage des laboratoires : article et présentation
- Année 2010
- Enquêtes sur les besoins de stockage :
- Présentation ARAMIS : GPU = un supercalculateur : du Mythe à la Réalité !
- Activités passées pré-CBP de 1993 à 2006