Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| recherche:projets:biologiecel [2013/06/19 06:16] – [Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images] cicaluga | recherche:projets:biologiecel [2018/06/19 08:07] (Version actuelle) – [Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images] cicaluga | ||
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| ===== Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images ===== | ===== Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images ===== | ||
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| + | Etudiante stagiaire : Typhaine Moreau | ||
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| * deliver the implementation as a plugin to existing computing platforms | * deliver the implementation as a plugin to existing computing platforms | ||
| - | Atomic-level computer simulation | + | * [[developpement: |
| + | * [[developpement: | ||
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| + | Publication : « Segmentation of 3D images of plant tissues at multiple scales | ||
| + | Plant Methods, 2017 Dec 21; 13, 114, https://doi.org/10.1186/s13007-017-0264-5 | ||
| ====== Contribution of CBP ====== | ====== Contribution of CBP ====== | ||
| * Etude du code d’origine (écrit en Python), et une évaluation préliminaire du coût de la réécriture du code en C++, de son optimisation et parallélisation | * Etude du code d’origine (écrit en Python), et une évaluation préliminaire du coût de la réécriture du code en C++, de son optimisation et parallélisation | ||
| + | * Adaptation du code pour permettre la prise en compte du format de fichier .tif | ||
| + | * Expertise et adaptation du code pour utilisation sur de différents plateformes et architectures | ||
| * Expertise au choix des méthodes numériques, | * Expertise au choix des méthodes numériques, | ||
| + | * Formation et soutien à la parallélisation avec OpenMP de codes des calcul développés | ||
| + | * Utilisation des ressources logistiques et informatiques (bureau, salle de réunion, salle des terminaux, etc.) | ||
| + | * Expertise au choix de la licence pour le nouveau logiciel écrit dans le cadre du projet | ||
| + | * Adaptation du code pour permettre des options supplémentaires | ||
| + | * Corrections de bogues pour améliorer la fiabilité du programme dans certains cas test | ||
| + | * Nous sommes très reconnaissants pour les ressources informatiques fournis par le PSMN. | ||