developpement:activites:integration:vmd4jessie

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement:activites:integration:vmd4jessie [2015/03/24 14:02]
equemene créée
+++ developpement:activites:integration:vmd4jessie [2015/04/28 13:37] (Version actuelle)
equemene
@@ Ligne 16: / Ligne 16: @@
 Les paquets suivants sont indispensables à la compilation et à l'utilisation de VMD
 <code>
-apt-get -y install libc6-dev-i386 libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc7 tk8.6 tk8.6-dev tcl8.6 tcl8.6-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon
+apt-get -y install libc6-dev libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc7 tk8.6 tk8.6-dev tcl8.6 tcl8.6-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon texlive-latex-base latex2html imagemagick
 </code>
 Pour les architectures 32 bits :
 <code>
-apt-get -y install libc6-dev libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc7 tk8.6 tk8.6-dev tcl8.6 tcl8.6-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon
+apt-get -y install libc6-dev libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc7 tk8.6 tk8.6-dev tcl8.6 tcl8.6-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon texlive-latex-base latex2html imagemagick
 </code>
@@ Ligne 74: / Ligne 74: @@
   * ''vmd-1.9.2'' : les sources de VMD
-La compilation des greffons demande les commandes suivantes :<code>
+La compilation des greffons demande les commandes suivantes :
+Pour du 64 bits :<code>
 # passage dans le dossier des greffons
 cd plugins
 # compilation en precisant l'architecture et le positionnement des librairies TCL
 export TCLINC="-I/usr/include/tcl8.6"
-export TCLLIB="-F/usr/lib"
+export TCLLIB="-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu"
+find . -exec sed -i "s/tcl8\.5/tcl8\.6/g" {} \;
 make $ARCH
 # installation des greffons
@@ Ligne 87: / Ligne 90: @@
 </code>
+Pour du 32 bits :<code>
+# passage dans le dossier des greffons
+cd plugins
+# compilation en precisant l'architecture et le positionnement des librairies TCL
+export TCLINC="-I/usr/include/tcl8.6"
+export TCLLIB="-L/usr/lib/i386-linux-gnu"
+find . -exec sed -i "s/tcl8\.5/tcl8\.6/g" {} \;
+make $ARCH
+# installation des greffons
+make distrib
+# retour à la racine de l'archive de VMD
+cd ..
+</code>
 ==== Compilation et installation de VMD version standard ====
@@ Ligne 98: / Ligne 114: @@
 export TCL_INCLUDE_DIR=/usr/include/tcl8.6
 export TCL_LIBRARY_DIR=/usr/lib/tcl8.6
+export TK_LIBRARY_DIR=/usr/lib/tk8.6
+export TK_INCLUDE_DIR=/usr/include/tcl8.6
 </code>
@@ Ligne 122: / Ligne 140: @@
 # Changement de la version de librairie pour Python
 sed -i "s/python2\.5/python2\.7/g" configure
+# Changement des versions de Tcl/Tk
+sed -i "s/tcl8\.5/tcl8\.6/g" configure
+sed -i "s/tk8\.5/tk8\.6/g" configure
+sed -i "s/tk8\.5/tk8\.6/g" src/Makefile
+sed -i "s/tcl8\.5/tcl8\.6/g" src/Makefile
 # Generation du Makefile
 ./configure $ARCH OPENGL FLTK TK XINPUT NETCDF CONTRIB TCL PYTHON PTHREADS NUMPY
@@ Ligne 155: / Ligne 178: @@
 # Changement de la version de librairie pour Python
 sed -i "s/python2\.5/python2\.7/g" configure
+sed -i "s/tcl8\.5/tcl8\.6/g" configure
+sed -i "s/tk8\.5/tk8\.6/g" configure
+sed -i "s/tk8\.5/tk8\.6/g" src/Makefile
+sed -i "s/tcl8\.5/tcl8\.6/g" src/Makefile
 # Generation du Makefile
 ./configure $ARCH OPENGL FLTK TK XINPUT NETCDF CONTRIB TCL PYTHON PTHREADS NUMPY
@@ Ligne 178: / Ligne 205: @@
 sed -i "s/-b(){}\[\],&^%#;|\\\\\\\//g" /usr/local/bin/$VMDINSTALLNAME
 </code>
-==== Compilation et installation de VMD version CUDA ====
-Le fichier ''configure'' de VMD n'est pas traditionnel : il n'est pas possible de paramétrer les variables à l'appel de la commande.
-Pour positionner les chemins des différentes librairies, voici quelques commandes :<code>
-cd $VMDINSTALLNAME
-mkdir lib/python
-ln -s /usr lib/python/lib_$ARCH
-mkdir lib/tcl
-ln -s /usr/lib lib/tcl/lib
-ln -s /usr/include/tcl8.6 lib/tcl/include
-</code>
-Configuration minimale du fichier ''configure'' pour pointer vers la librairie CUDA. Il est supposé que ''cuda'' est installée dans ''/opt/cuda'' et est appelée en 64 bits :<code>
-# Premiere subsitution sur Cuda
-sed -i 's/\/usr\/local\/encap\/cuda-3.0/\/opt\/cuda/g' configure
-# Seconde subsitution sur Cuda
-sed -i 's/\/usr\/local\/encap\/cuda-3.0/\/opt\/cuda/g' configure
-# Remplacement
-sed -i 's/\/usr\/local\/cuda\/bin/\/opt\/cuda\/bin/g' configure
-sed -i 's/\/usr\/local\/include/\/opt\/cuda\/include/g' configure
-sed -i 's/\/usr\/local\/cuda\/include/\/opt\/cuda\/include/g' configure
-sed -i 's/\/usr\/local\/cuda\/lib/\/opt\/cuda\/lib/g' configure
-# Remplacement de la version de librairie par son modele 64 bits
-sed -i 's/\/opt\/cuda\/lib/\/opt\/cuda\/lib64/g' configure
-#
-sed -i 's/6464/64/g' configure
-</code>
-Génération du ''Makefile'', compilation et installation :<code>
-# Generation du Makefile
-./configure $ARCH OPENGL TK FLTK XINPUT NETCDF CONTRIB TCL PYTHON PTHREADS CUDA
-cd src
-# Compilation
-make
-# installation du programme et des librairies (il est supposé que l'installateur a les droits sudo)
-sudo make install
-</code>
-Quelques commandes cosmétiques supplémentaires :<code>
-cd /opt
-ln -s $VMDINSTALLNAME vmd
-cd vmd
-chown -R root.root *
-cd /usr/local/bin
-ln -s $VMDINSTALLNAME vmd
-</code>
-==== Compilation et installation de VMD version OpenCL ====
-Le fichier ''configure'' de VMD n'est pas traditionnel : il n'est pas possible de paramétrer les variables à l'appel de la commande.
-Pour positionner les chemins des différentes librairies, voici quelques commandes :<code>
-cd $VMDINSTALLNAME
-mkdir lib/python
-ln -s /usr lib/python/lib_$ARCH
-mkdir lib/tcl
-ln -s /usr/lib lib/tcl/lib
-ln -s /usr/include/tcl8.6 lib/tcl/include
-</code>
-Configuration minimale du fichier ''configure'' pour pointer vers la librairie OpenCL de ATI/AMD. Il est supposé que ''OpenCL'' est installée dans ''/opt/AMDAPP'' (version 2.5 du SDK) et est appelée en 64 bits :
-Version pour SDK AMD/ATI installé dans ''/opt/AMDAPP''
-<code>
-# Premiere substitution
-sed -i 's/\#\$opencl_library/\$opencl_library\ =\ \"\-L\/opt\/AMD\-APP\-SDK\/lib\/x86_64\"\;\n\#\$opencl_library/g' configure
-# Seconde substitution
-sed -e 's/\/usr\/include\/CL/\/opt\/AMD\-APP\-SDK\/include/g' configure
-</code>
-Génération du ''Makefile'', compilation et installation :<code>
-# Generation du Makefile
-./configure $ARCH OPENGL TK FLTK XINPUT NETCDF CONTRIB TCL PYTHON PTHREADS OPENCL
-cd src
-# Compilation
-make
-# installation du programme et des librairies (il est supposé que l'installateur a les droits sudo)
-sudo make install
-</code>
-Quelques commandes cosmétiques supplémentaires :<code>
-cd /opt
-ln -s $VMDINSTALLNAME vmd
-cd vmd
-chown -R root.root *
-cd /usr/local/bin
-ln -s $VMDINSTALLNAME vmd
-</code>
-http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/mailing_list/vmd-l/19158.html
 ==== Installation dans l'environnement Gnome ====

developpement/activites/integration/vmd4jessie.1427202137.txt.gz · Dernière modification: 2015/03/24 14:02 par equemene

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