developpement:activites:integration:vmd4dwheezy

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement:activites:integration:vmd4dwheezy [2013/03/22 15:47] – [Installation de Visual Molecular Dynamics sous Debian Wheezy] sbarends
+++ developpement:activites:integration:vmd4dwheezy [2013/05/15 12:16] (Version actuelle) – [Installation dans l'environnement Gnome] equemene
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 Les paquets suivants sont indispensables à la compilation et à l'utilisation de VMD
 <code>
-apt-get -y install libc6-dev-i386 libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc6 tk8.5 tk8.5-dev tcl8.5 tcl8.5-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon
+apt-get -y install libc6-dev-i386 libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc7 tk8.5 tk8.5-dev tcl8.5 tcl8.5-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon
 </code>
 Pour les architectures 32 bits :
 <code>
-apt-get -y install libc6-dev libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc6 tk8.5 tk8.5-dev tcl8.5 tcl8.5-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon
+apt-get -y install libc6-dev libfltk1.1-dev libfltk1.1 netcdf-bin libnetcdf-dev libnetcdfc7 tk8.5 tk8.5-dev tcl8.5 tcl8.5-dev libglu1-mesa mesa-common-dev libgl1-mesa-dri libglu1-mesa-dev libxi-dev libxi6 python2.7 python2.7-dev python-numpy libtachyon-0.99 libtachyon-dev tachyon
 </code>
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 mv strideLINUX stride_LINUX
 cd ../..
-ogramme
-make install
 # Changement de la version de librairie pour Python
 sed -i "s/python2\.5/python2\.7/g" configure
@@ Ligne 177: / Ligne 175: @@
 </code>
+Une commande utile, dans l'environnement SIDUS, pour que VMD soit fonctionnel :<code>
+sed -i "s/-b(){}\[\],&^%#;|\\\\\\\//g" /usr/local/bin/$VMDINSTALLNAME
+</code>
 ==== Compilation et installation de VMD version CUDA ====
@@ Ligne 265: / Ligne 266: @@
 cd /usr/local/bin
 ln -s $VMDINSTALLNAME vmd
+</code>
+http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/mailing_list/vmd-l/19158.html
+==== Installation dans l'environnement Gnome ====
+Par défaut, la Debian Wheezy propose Gnome Unity.
+Pour installer une icône directement dans le dossier Science, voici la commande pour créer manuellement cette entrée :
+<code>
+tee /usr/share/applications/VMD.desktop <<EOF
+[Desktop Entry]
+Version=1.0
+Encoding=UTF-8
+Name=VMD
+GenericName=VMD
+Comment=Visual Molecular Dynamics (not Open Source one :-( )
+Exec=/usr/local/bin/vmd
+Icon=/opt/vmd/plugins/noarch/tcl/molefacture1.3/lib/nucleic_acids/dna_dihedrals.gif
+Type=Application
+Terminal=true
+Categories=Science;Education;Chemistry,Biology;
+EOF
 </code>
  --- //[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2013/03/21 10:20//

developpement/activites/integration/vmd4dwheezy.1363967245.txt.gz · Dernière modification : 2025/05/14 07:38 (modification externe)

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