developpement:activites:integration:gaussian4jessie

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement:activites:integration:gaussian4jessie [2015/03/20 12:30] – [Test des compilations] equemene
+++ developpement:activites:integration:gaussian4jessie [2018/03/23 15:13] (Version actuelle) – [Introduction] equemene
@@ Ligne 3: / Ligne 3: @@
 ====== Installation de Gaussian sous Debian Jessie ======
-<note warning>Migration de Wheezy vers Jessie</note>
@@ Ligne 18: / Ligne 17: @@
 Les notes qui vont suivre permettent pas à pas, moyennant des opérations assez lourdes (patcher un code propriétaire directement n'est pas une étape anodine), de récupérer un Gaussian fonctionnel...
-Pour son utilisation, vous pouvez consulter le [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/dokuwiki/doku.php?id=tools4test|"pied à l'étrier"]] rédigé pour les applications scientifiques installées dans le cadre de la formation Atosim.
+===== Installation =====
   - Installation de quelques paquets Debian et leurs dépendances :<code>
@@ Ligne 39: / Ligne 38: @@
   - Récupération du //patch// et son application pour compiler avec GFortran :<code>
 cd g09
-# pour une distribution Debian Wheezy sous 64 bits :
+# pour une distribution Debian Jessie sous 64 bits :
-wget http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/software/Gaussian/g09.wheezy64
+wget http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/software/Gaussian/g09.jessie64
-# La ligne suivante s'applique a la version pour la Debian Squeeze 64 bits
+# La ligne suivante s'applique a la version pour la Debian Jessie 64 bits
-patch -p 1 -i ./g09.wheezy64
+patch -p 1 -i ./g09.jessie64
 </code>
     * La sortie doit présenter les lignes suivantes :<code>
@@ Ligne 63: / Ligne 62: @@
+===== Utilisation de Gaussian =====
+Avant toute utilisation de Gaussian dans la salle de formation, les commandes suivantes sont à appliquer :<code>
+mkdir -p /local/$USER/Gaussian/tmp 2>/dev/null
+export g09root=/opt
+export GAUSS_SCRDIR=/local/$USER/Gaussian/tmp
+. $g09root/g09/bsd/g09.profile
+</code>
+Il est recommandé, en cas d'utilisation récurrente de Gaussian, de copier les 4 lignes précédentes dans son ''$HOME/.bashrc''/
 ===== Test des compilations =====
-Par défaut, le source de Gaussian comprend les résultats de tests sur architecture IA64 dans le dossier ''$g09root/g09/tests/ia64''.
+Par défaut, le source de Gaussian comprend les résultats de tests sur architecture AMD64 dans le dossier ''$g09root/g09/tests/amd64''.
 Pour exécuter tous les tests, voici la commande <code>
@@ Ligne 81: / Ligne 91: @@
 cd /local/$USER/Gaussian
 cp $g09root/g09/tests/com/test*[0-9][0-9].com /local/$USER/Gaussian
-i=0
+for i in $(seq 0 1 1044)
-while [ $i -le 1044 ]
 do
   if [ -f test$(printf "%04d" $i).com ]; then
      { /usr/bin/time g09 test$(printf "%04d" $i).com ; } 2> test$(printf "%04d" $i).time
   fi
-  i=$(($i+1))
 done
 </code>
@@ Ligne 93: / Ligne 101: @@
 ===== Commandes annexes =====
-Pour établir les patchs à appliquer par rapport à l'archive de sources originelle, la commande suivante a été utilisée :<code>diff -crB g09 g09.work > g09.wheezy64</code>
+Pour établir les patchs à appliquer par rapport à l'archive de sources originelle, la commande suivante a été utilisée :<code>diff -crB g09 g09.work > g09.jessie64</code>
+ --- //[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2015/03/23 09:50//

developpement/activites/integration/gaussian4jessie.1426854627.txt.gz · Dernière modification : 2025/05/14 07:38 (modification externe)

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