Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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developpement:activites:integration:hpl4squeeze [2013/03/22 16:21] sbarends créée |
developpement:activites:integration:hpl4squeeze [2015/01/07 10:04] |
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| - | ====== Compilation de XHPL sous Debian ====== | ||
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| - | <note important>Pour utiliser xHPL, mieux vaut directement aller sur le projet de la forge du CBP dédiée : https://forge.cbp.ens-lyon.fr/redmine/projects/hpl4all</note> | ||
| - | ===== Introduction ===== | ||
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| - | Le logiciel [[http://www.netlib.org/benchmark/hpl/|hpl]] est une implémentation du fameux Linpack utilisé pour estimer la puissance des machines, notamment pour le [[www.top500.org|classement Top500]] des machines les plus puissantes de la planète. | ||
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| - | La dernière version, la [[http://www.netlib.org/benchmark/hpl/hpl-2.0.tar.gz|2.0]] date du 10 septembre 2008 : <code>wget http://www.netlib.org/benchmark/hpl/hpl-2.0.tar.gz</code> | ||
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| - | ===== Installation des prérequis ===== | ||
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| - | Comme le veut la tradition, le système "souche" sera une Linux Debian, version Lenny (5.0.3). | ||
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| - | Les librairies suivantes seront utilisées : | ||
| - | * ensemble Atlas pour les librairies d'algèbre linéaire | ||
| - | * ensemble OpenMPI pour la distribution des calculs sur les noeuds | ||
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| - | <code> | ||
| - | sudo apt-get install gcc gfortran | ||
| - | sudo apt-get install openmpi-bin openmpi-common libopenmpi-dev | ||
| - | # Sur une architecture i386 | ||
| - | sudo apt-get install libatlas-test libatlas3gf-base libatlas-headers libatlas-base-dev libatlas-sse2-dev libatlas3gf-sse2 | ||
| - | # Sur une architecture amd64 | ||
| - | sudo apt-get install libatlas-test libatlas3gf-base libatlas-headers libatlas-base-dev | ||
| - | </code> | ||
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| - | ===== Compilation ===== | ||
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| - | * Préparation de l'archive : (plutôt à la racine de l'utilisateur)<code> | ||
| - | cd $HOME | ||
| - | wget http://www.netlib.org/benchmark/hpl/hpl-2.0.tar.gz | ||
| - | tar xzf hpl-2.0.tar.gz | ||
| - | ln -s hpl-2.0 hpl | ||
| - | cd hpl | ||
| - | </code> | ||
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| - | * Compilation : | ||
| - | * la phase de compilation est assez hardue : elle consiste à créer son propre //MakeFile//, sous la forme d'un Make.MonMakefileAMoi | ||
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| - | * étant donné que, en informatique, il faut savoir être fainéant, avant, vous pouviez récupérer les //Makefile// d'une [[http://pagesperso-orange.fr/klhpc/tutoriels/hpl/|parge perso de Orange]] maintenant disparue. Vous pouvez cependant en récupérer les sauvegardes : <code> | ||
| - | wget http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/software/HPL/Make.Debian_BLAS_gm | ||
| - | wget http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/software/HPL/Make.Debian_CBLAS_gm | ||
| - | wget http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/software/HPL/Make.Debian_FBLAS_gm | ||
| - | </code> | ||
| - | * importer ces documents et les placer à la racine de HPL : <code>mv Make.Debian_* $HOME/hpl</code> | ||
| - | * compiler les différents //Makefile// : <code> | ||
| - | make arch=Debian_BLAS_gm | ||
| - | make arch=Debian_CBLAS_gm | ||
| - | make arch=Debian_FBLAS_gm | ||
| - | </code> | ||
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| - | ===== Exécution des benchs ===== | ||
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| - | Les exécutables ainsi compilés se trouvent dans $HOME/hpl/bin | ||
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| - | Pour les exécuter, trois opérations : | ||
| - | - se déplacer dans l'un des répertoires, au choix :<code> | ||
| - | cd $HOME/hpl/bin/Debian_BLAS_gm | ||
| - | cd $HOME/hpl/bin/Debian_CBLAS_gm | ||
| - | cd $HOME/hpl/bin/Debian_FBLAS_gm | ||
| - | </code> | ||
| - | - paramétrer le fichier de configuration HPL.dat : <code> | ||
| - | HPLinpack benchmark input file | ||
| - | Innovative Computing Laboratory, University of Tennessee | ||
| - | HPL.out output file name (if any) | ||
| - | file device out (6=stdout,7=stderr,file) | ||
| - | 1 # of problems sizes (N) | ||
| - | 2560 Ns | ||
| - | 1 # of NBs | ||
| - | 256 NBs | ||
| - | 0 PMAP process mapping (0=Row-,1=Column-major) | ||
| - | 1 # of process grids (P x Q) | ||
| - | 1 Ps | ||
| - | 2 Qs | ||
| - | -16.0 threshold | ||
| - | 3 # of panel fact | ||
| - | 0 1 2 PFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right) | ||
| - | 2 # of recursive stopping criterium | ||
| - | 2 4 NBMINs (>= 1) | ||
| - | 1 # of panels in recursion | ||
| - | 2 NDIVs | ||
| - | 3 # of recursive panel fact. | ||
| - | 0 1 2 RFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right) | ||
| - | 1 # of broadcast | ||
| - | 0 BCASTs (0=1rg,1=1rM,2=2rg,3=2rM,4=Lng,5=LnM) | ||
| - | 1 # of lookahead depth | ||
| - | 0 DEPTHs (>=0) | ||
| - | 2 SWAP (0=bin-exch,1=long,2=mix) | ||
| - | 64 swapping threshold | ||
| - | 0 L1 in (0=transposed,1=no-transposed) form | ||
| - | 0 U in (0=transposed,1=no-transposed) form | ||
| - | 1 Equilibration (0=no,1=yes) | ||
| - | 16 memory alignment in double (> 0) | ||
| - | </code> | ||
| - | - Lancer le bench :<code>orterun -np 2 ./xhpl</code> | ||
| - | * en sortie, même si les résultats sont consignés dans un fichier HPL.out, on obtient :<code> | ||
| - | ================================================================================ | ||
| - | HPLinpack 2.0 -- High-Performance Linpack benchmark -- September 10, 2008 | ||
| - | Written by A. Petitet and R. Clint Whaley, Innovative Computing Laboratory, UTK | ||
| - | Modified by Piotr Luszczek, Innovative Computing Laboratory, UTK | ||
| - | Modified by Julien Langou, University of Colorado Denver | ||
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| - | An explanation of the input/output parameters follows: | ||
| - | T/V : Wall time / encoded variant. | ||
| - | N : The order of the coefficient matrix A. | ||
| - | NB : The partitioning blocking factor. | ||
| - | P : The number of process rows. | ||
| - | Q : The number of process columns. | ||
| - | Time : Time in seconds to solve the linear system. | ||
| - | Gflops : Rate of execution for solving the linear system. | ||
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| - | The following parameter values will be used: | ||
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| - | N : 2560 | ||
| - | NB : 256 | ||
| - | PMAP : Row-major process mapping | ||
| - | P : 1 | ||
| - | Q : 2 | ||
| - | PFACT : Left Crout Right | ||
| - | NBMIN : 2 4 | ||
| - | NDIV : 2 | ||
| - | RFACT : Left Crout Right | ||
| - | BCAST : 1ring | ||
| - | DEPTH : 0 | ||
| - | SWAP : Mix (threshold = 64) | ||
| - | L1 : transposed form | ||
| - | U : transposed form | ||
| - | EQUIL : yes | ||
| - | ALIGN : 16 double precision words | ||
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| - | ================================================================================ | ||
| - | T/V N NB P Q Time Gflops | ||
| - | -------------------------------------------------------------------------------- | ||
| - | WR00L2L2 2560 256 1 2 4.29 2.612e+00 | ||
| - | WR00L2L4 2560 256 1 2 4.23 2.648e+00 | ||
| - | WR00L2C2 2560 256 1 2 4.26 2.628e+00 | ||
| - | WR00L2C4 2560 256 1 2 4.22 2.652e+00 | ||
| - | WR00L2R2 2560 256 1 2 4.24 2.638e+00 | ||
| - | WR00L2R4 2560 256 1 2 4.23 2.643e+00 | ||
| - | WR00C2L2 2560 256 1 2 4.26 2.630e+00 | ||
| - | WR00C2L4 2560 256 1 2 4.24 2.642e+00 | ||
| - | WR00C2C2 2560 256 1 2 4.25 2.637e+00 | ||
| - | WR00C2C4 2560 256 1 2 4.24 2.639e+00 | ||
| - | WR00C2R2 2560 256 1 2 4.26 2.631e+00 | ||
| - | WR00C2R4 2560 256 1 2 4.22 2.655e+00 | ||
| - | WR00R2L2 2560 256 1 2 4.26 2.629e+00 | ||
| - | WR00R2L4 2560 256 1 2 4.21 2.656e+00 | ||
| - | WR00R2C2 2560 256 1 2 4.26 2.628e+00 | ||
| - | WR00R2C4 2560 256 1 2 4.21 2.660e+00 | ||
| - | WR00R2R2 2560 256 1 2 4.23 2.646e+00 | ||
| - | WR00R2R4 2560 256 1 2 4.23 2.645e+00 | ||
| - | ================================================================================ | ||
| - | |||
| - | Finished 18 tests with the following results: | ||
| - | 18 tests completed without checking, | ||
| - | 0 tests skipped because of illegal input values. | ||
| - | -------------------------------------------------------------------------------- | ||
| - | |||
| - | End of Tests. | ||
| - | ================================================================================ | ||
| - | </code> | ||
| - | * on remarque que ce vieux Pentium 4 HT a une puissance de 2.6 GFps | ||
| - | * les résultats sont comparables en BLAS, CBLAS et FBLAS | ||
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| - | ===== Références ===== | ||
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| - | * http://wiki.generation-debian.org/doku.php/bench | ||
| - | * http://pagesperso-orange.fr/klhpc/tutoriels/hpl/ | ||