developpement:activites:integration:dnabend4wheezy

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement:activites:integration:dnabend4wheezy [2013/06/10 10:33]
equemene [Intégration de DNABend sur une Debian Wheezy]
+++ developpement:activites:integration:dnabend4wheezy [2013/06/10 11:32]
equemene [Installation des prérequis]
@@ Ligne 9: / Ligne 9: @@
 ==== Installation des prérequis ====
-<code>
+Comme nous allons le découvrir à la compilation, DNABend, dans sa version "standard", ne compile qu'avec la version la plus vieille de G++ intégrée dans la Debian Wheezy, la version 4.4. Il existe également une forte dépendance à GSL
+<code>
+apt-get install libc6 libc6-i386 libgcc1 libgsl0ldbl libstdc++6 g++-4.4 libgsl0-dev libstdc++6-4.4-dev
 </code>
@@ Ligne 19: / Ligne 21: @@
 <code>
 cd /root
-wget
+wget http://nucleosome.rutgers.edu/nucleosome/DNABEND_1.1.tgz
 </code>
@@ Ligne 26: / Ligne 28: @@
 <code>
 cd /opt
-tar xzf
+tar xzf /root/DNABEND_1.1.tgz
-cd
+</code>
+==== Modification des sources ====
+<code>
+mv /opt/DNABEND_1.1/source/Makefile /opt/DNABEND_1.1/source/Makefile.orig
+wget -O /opt/DNABEND_1.1/source/Makefile http://www.cbp.ens-lyon.fr/software/DNABEND/Makefile.DNABEND
+sed -i 's/<string>/<string.h>/g' /opt/DNABEND_1.1/include/dna_parameters.h
 </code>
 ==== Compilation ====
-  * modification du ''Makefile''
+<code>
-    * compilateur g++-4.4 indispensable
+cd /opt/DNABEND_1.1/source
-    *
+make clean
-  * modification de ''dna_parameters.h''
+make esolve
-    * changement de <string> en <string.h>
+make edesign
+</code>
+Les exécutables se trouvent dans ''/opt/DNABEND_1.1'' : ''edesign'' et ''esolve''.
 ==== Installation ====

developpement/activites/integration/dnabend4wheezy.txt · Dernière modification: 2015/01/07 10:04 (modification externe)

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