Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
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ressources:miniconda4cbp [2022/11/20 15:33] equemene |
ressources:miniconda4cbp [2024/02/16 16:40] (Version actuelle) equemene [Récupération de l'installeur Miniconda] |
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| ===== Utilisation du miniconda embarqué ===== | ===== Utilisation du miniconda embarqué ===== | ||
| - | Pour exploiter le **miniconda3** version **4.9.2** installé au Centre Blaise Pascal sur les machines du domaine | + | Pour exploiter le **miniconda3** version **23.3.1** installé au Centre Blaise Pascal sur les machines du domaine |
| [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/python/forms/CloudCBP|CLoudCBP]], il suffit de taper dans un terminal :<code> | [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/python/forms/CloudCBP|CLoudCBP]], il suffit de taper dans un terminal :<code> | ||
| - | module load conda3/4.9.2 | + | module load conda3/23.3.1 |
| </code> | </code> | ||
| - | Ce **miniconda3** comprend notamment les outils suivants :<code> | + | Ce **miniconda3** comprend notamment les outils classiques de //machine learning// PyTorch et Tensorflow. |
| - | cudnn 7.6.5 cuda10.1_0 anaconda | + | |
| - | cupti 10.1.168 0 anaconda | + | |
| - | ninja 1.11.0 h924138e_0 conda-forge | + | |
| - | pytorch 1.7.1 cpu_py39h714fb45_2 conda-forge | + | |
| - | revbayes 1.0.13 ha44abe0_2 bioconda | + | |
| - | scikit-learn 0.23.2 py39hf3c863f_2 conda-forge | + | |
| - | tensorboard-plugin-wit 1.6.0 py_0 anaconda | + | |
| - | tensorflow-metadata 0.14.0 pyhe6710b0_1 anaconda | + | |
| - | </code> | + | |
| ===== Installation de son propre miniconda ===== | ===== Installation de son propre miniconda ===== | ||
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| Pour récupérer le dernier installeur Miniconda pour **Python 3.9**, tapez les commandes suivantes :<code> | Pour récupérer le dernier installeur Miniconda pour **Python 3.9**, tapez les commandes suivantes :<code> | ||
| cd $HOME | cd $HOME | ||
| - | wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh | + | wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O $HOME/Miniconda.sh |
| - | mv Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh Miniconda3.sh | + | |
| </code> | </code> | ||
| Ligne 69: | Ligne 59: | ||
| </code> | </code> | ||
| - | <note warning>Attention ! Avant d'installer un environnement **conda** dans un dossier dans ''/projects'', ''/scratch'' ou ''/local'', assurez-vous de créer **d'abord** le dossier avec ''mkdir /projects/users/$USER'', ''/scratch/$USER'' ou ''/local/$USER''</note> | + | <note warning>Attention ! Avant d'installer un environnement **conda** dans un dossier dans ''/projects'', ''/scratch'' ou ''/local'', assurez-vous de créer **d'abord** le dossier avec ''mkdir /projects/users/$USER'', ''mkdir /scratch/$USER'' ou ''mkdir /local/$USER''</note> |
| ==== Lancement de l'environnement Conda installé ==== | ==== Lancement de l'environnement Conda installé ==== | ||
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| * ''/scratch/jmylq/miniconda3/condabin'' | * ''/scratch/jmylq/miniconda3/condabin'' | ||
| - | ==== Installation d'un logiciel dans l'environnement Conda installée ==== | + | ==== Installation d'un logiciel dans l'environnement Conda configuré ==== |
| Une fois l'environnement chargé avec ''source $HOME/CondaLatest.rc'', il suffit de taper ''conda install <Logiciel>'' pour que **Conda** recherche les dépendances, les installe puis installe le logiciel spécifié. | Une fois l'environnement chargé avec ''source $HOME/CondaLatest.rc'', il suffit de taper ''conda install <Logiciel>'' pour que **Conda** recherche les dépendances, les installe puis installe le logiciel spécifié. | ||