Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- ressources:miniconda4cbp [2021/06/01 11:41]
equemene [Installation de l'application]
+++ ressources:miniconda4cbp [2024/02/16 16:40] (Version actuelle)
equemene [Récupération de l'installeur Miniconda]
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-====== Installation de Miniconda au Centre Blaise Pascal ======
+====== Exploitation ou Installation de Miniconda au Centre Blaise Pascal ======
+===== Utilisation du miniconda embarqué =====
+Pour exploiter le **miniconda3** version **23.3.1** installé au Centre Blaise Pascal sur les machines du domaine
+[[http://www.cbp.ens-lyon.fr/python/forms/CloudCBP|CLoudCBP]], il suffit de taper dans un terminal :<code>
+module load conda3/23.3.1
+</code>
+Ce **miniconda3** comprend notamment les outils classiques de //machine learning// PyTorch et Tensorflow.
+===== Installation de son propre miniconda =====
 Miniconda est un outil permettant à chaque utilisateur d'installer un environnement Python (et ses dépendances) pour ses propres besoins. C'est devenu nécessaire voire indispensable pour les applications demandant des versions très spécifiques de librairies.
-L'installation de son environneemnt personnel se décompose en 3 phases :
+L'installation de son environnement personnel se décompose en 3 phases :
   - récupération de l'installeur ''miniconda'' sur le [[https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html#linux-installers|site de conda]]
   - installation de l'application à l'endroit adapté
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 Pour récupérer le dernier installeur Miniconda pour **Python 3.9**, tapez les commandes suivantes :<code>
 cd $HOME
-wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
+wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O $HOME/Miniconda.sh
-mv Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh Miniconda3.sh
 </code>
 ===== Installation de l'application =====
-<note important>A moins de savoir EXACTEMENT ce que vous faites, il est VIVEMENT déconseillé d'installer Miniconda dans son espace utilisateur personnel (le ''$HOME''). En effet, **Conda** (''Miniconda'' ou ''Anaconda'') installent des centaines de milliers de fichiers. Le ''$HOME'' de chaque utilisateur est par défaut limité à 20GB et 500000 [[https://fr.wikipedia.org/wiki/N%C5%93ud_d%27index|inodes]]. Vous risquez donc de remplir votre espace utilisateur avec une simple installation de **Conda**</note>
+<note important>A moins de savoir EXACTEMENT ce que vous faites, il est VIVEMENT déconseillé d'installer Miniconda dans son espace utilisateur personnel (le ''$HOME''). En effet, **Conda** (''Miniconda'' ou ''Anaconda'') installe des centaines de milliers de fichiers. Le ''$HOME'' de chaque utilisateur est par défaut limité à 20GB et 500000 [[https://fr.wikipedia.org/wiki/N%C5%93ud_d%27index|inodes]]. Vous risquez donc de remplir votre espace utilisateur avec une simple installation de **Conda**</note>
 L'installation de compose de 7 étapes :
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 [/home/<MyLogin>/miniconda3] >>></code>
+    * vous pouvez spécifier un autre endroit comme, par exemple dans l'espace //projets// ''projects''
+      * pour vous en particulier : ''/projects/users/$USER/Miniconda3''
+      * pour un projet en particulier : ''/projects/<MonProjet>/Miniconda3''
   - modification de la configuration du shell : tapez ''yes'' à l'invite python <code>Do you wish the installer to initialize Miniconda3
 by running conda init? [yes|no]
 </code>
+<hidden>Section masquée</hidden>
 Par défaut, la configuration de votre shell est modifiée : à chaque ouverture de terminal, l'environnement **Conda** sera chargé, ce qui peut poser des difficultés si vous travaillez avec plusieurs environnements.
 Le mieux est d'appliquer les deux commandes suivantes pour retrouver son environnement initial ET extraire de quoi lancer à discrétion l'environnement **Conda** :<code>
-tail -15 $HOME/.bashrc > CondaLatest.sh
+tail -15 $HOME/.bashrc > CondaLatest.rc
 cp $HOME/.bashrc.orig $HOME/.bashrc
 </code>
+<note warning>Attention ! Avant d'installer un environnement **conda** dans un dossier dans ''/projects'', ''/scratch'' ou ''/local'', assurez-vous de créer **d'abord** le dossier avec ''mkdir /projects/users/$USER'', ''mkdir /scratch/$USER'' ou ''mkdir /local/$USER''</note>
 ==== Lancement de l'environnement Conda installé ====
-De manière à lancer l'environnement **Conda**, il suffit de lancer la commande : ''source $HOME/CondaLatest.sh''.
+De manière à lancer l'environnement **Conda**, il suffit de lancer la commande : ''source $HOME/CondaLatest.rc''.
 Dans un terminal :<code>
 jmylq@threadripper:~$ echo $PATH
 /usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/games:/usr/games
-jmylq@threadripper:~$ source $HOME/CondaLatest.sh
+jmylq@threadripper:~$ source $HOME/CondaLatest.rc
 (base) jmylq@threadripper:~$ echo $PATH
 /scratch/jmylq/miniconda3/bin:/scratch/jmylq/miniconda3/condabin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/games:/usr/games
@@ Ligne 64: / Ligne 78: @@
   * ''/scratch/jmylq/miniconda3/condabin''
+==== Installation d'un logiciel dans l'environnement Conda configuré ====
+Une fois l'environnement chargé avec ''source $HOME/CondaLatest.rc'', il suffit de taper ''conda install <Logiciel>'' pour que **Conda** recherche les dépendances, les installe puis installe le logiciel spécifié.
+Par exemple, pour l'installation de machine learning **pytorch** : ''conda install pytorch''
 ==== Logs complets d'une installation ====

ressources/miniconda4cbp.1622540479.txt.gz · Dernière modification: 2021/06/01 11:41 par equemene

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