Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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ressources:gridengine4cbp [2018/06/14 11:05] equemene [Introduction] |
ressources:gridengine4cbp [2020/12/17 19:03] equemene [Introduction] |
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| dispose d'une infrastructure de production]]. | dispose d'une infrastructure de production]]. | ||
| - | Les équipements mis à disposition derrière le soumissionneur GridEngine se composent de 84 noeuds dans 4 groupes différents pour un total de 832 coeurs et 2176 Go de RAM. | + | Les équipements mis à disposition derrière le soumissionneur GridEngine se composent de 166 noeuds dans 8 groupes différents pour un total de 1416 coeurs et 6016 Go de RAM. |
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| + | Sur les 72 noeuds R410 arrivés entre le printemps 2014 et l'automne 2015, tous sont disponibles via le gestionnaire GridEngine. Les 16 C6100 agrègent leur stockage individuel pour servir l'espace partagé ''/distonet''. Les SL230 ne disposent | ||
| - | Sur les 72 noeuds R410 arrivés entre le printemps 2014 et l'automne 2015, tous sont disponibles via le gestionnaire GridEngine. Les noeuds C6100 sont des équipements de prêt connectés un chassis hôte de GPGPU C410X. | ||
| | **Cluster** | **Marque** | **Modèle** | **Noeuds** | **Coeurs /Noeud** |**RAM /Noeud**|**Réseau GE**|**Réseau IB**|**Total Coeurs**|**Total RAM**| | | **Cluster** | **Marque** | **Modèle** | **Noeuds** | **Coeurs /Noeud** |**RAM /Noeud**|**Réseau GE**|**Réseau IB**|**Total Coeurs**|**Total RAM**| | ||
| - | | **r410ddr** | Dell | R410 | 8 | 8 | 24 Go | GE | IB DDR | 64 | 192 Go | | + | | **r422** | Supermicro | R422 | 64 | 8 | 48 Go | GE | IB QDR | 512 | 3072 Go | |
| | **r410qdr** | Dell | R410 | 64 | 8 | 24 Go | GE | IB QDR | 512 | 1536 Go | | | **r410qdr** | Dell | R410 | 64 | 8 | 24 Go | GE | IB QDR | 512 | 1536 Go | | ||
| - | | **c61gpu** | Dell | C6100 | 4 | 12 | 48 Go | GE | IB QDR | 48 | 192 Go | | + | | **r410ddr** | Dell | R410 | 4 | 8 | 24 Go | GE | IB DDR | 32 | 96 Go | |
| - | | **sl230** | HP | SL230 | 8 | 8/16 | 16/32/64 Go | GE | IB QDR | 64 | 240 Go | | + | | **c61** | Dell | C6100 | 16 | 12 | 24 Go | GE | IB QDR | 192 | 384 Go | |
| - | | **x41z** | Sun | x41z | 8 | 8 | 32Go | GE | IB DDR | 64 | 256 Go | | + | | **c82** | Dell | C8220 | 4 | 16 | 64 Go | GE | IB QDR | 64 | 256 Go | |
| - | | **x4500** | Sun | x4500 | 4 | 4 | 16Go | GE | IB SDR | 16 | 64 Go | | + | | **sl230** | HP | SL230 | 8 | 8 | 64 Go | GE | IB FDR | 64 | 512 Go | |
| - | | **x2200** | Sun | x2200 | 2 | 4 | 32Go | GE | IB DDR | 8 | 64 Go | | + | | **x41z** | Sun | x41z | 4 | 8 | 32 Go | GE | IB DDR | 64 | 128 Go | |
| - | | **v20z** | Sun | v20z | 2 | 2 | 16Go | GE | IB SDR | 4 | 32 Go | | + | | **x4500** | Sun | x4500 | 2 | 4 | 16 Go | GE | IB SDR | 16 | 32 Go | |
| Ces clusters partagent exactement la même image de système, [[developpement:productions:sidus|Sidus]] (pour Single Instance Distributing Universal System), un système complet Debian intégrant tous les paquets scientifiques ainsi que de nombreux paquets de développement. | Ces clusters partagent exactement la même image de système, [[developpement:productions:sidus|Sidus]] (pour Single Instance Distributing Universal System), un système complet Debian intégrant tous les paquets scientifiques ainsi que de nombreux paquets de développement. | ||
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| ===== Dossiers personnels ===== | ===== Dossiers personnels ===== | ||
| - | Sur la passerelle ''lethe'', chaque utilisateur dispose de 3 espaces utilisateurs : | + | Sur la passerelle ''lethe'', chaque utilisateur dispose de 4 espaces utilisateurs : |
| * un local dans ''/home/<login>'' | * un local dans ''/home/<login>'' | ||
| * un général dans ''/cbp/<login>'' | * un général dans ''/cbp/<login>'' | ||
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| * un projet dans ''/projects'' | * un projet dans ''/projects'' | ||
| - | Le second correspond à l'espace utilisateur de ressources informatiques du CBP lorsqu'il se connecte : | + | Le second, ''/cbp/<login>/'' correspond à l'espace utilisateur de ressources informatiques du CBP lorsqu'il se connecte : |
| - | * aux 21 stations de travail de la salle libre service | + | * aux 28 stations de travail de la salle libre service |
| * à la station graphique 3D de la petite salle de réunion | * à la station graphique 3D de la petite salle de réunion | ||
| * aux machines à la demande SIDUS (Single Instance Distributing Universal System) | * aux machines à la demande SIDUS (Single Instance Distributing Universal System) | ||
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| La commande d'examen des tâches en cours ''qstat'' permet ensuite de savoir que le job a bien été pris en compte. | La commande d'examen des tâches en cours ''qstat'' permet ensuite de savoir que le job a bien été pris en compte. | ||
| + | === Récupérer les informations sur ses jobs exécutés === | ||
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| + | Dans le fichier de batch (celui qui définit les commandes à exécuter avec la queue, l'environnement, etc...) apparait le paramètre préfixé de ''-N''. Ce paramètre est très utile parce que, comme le précise les exemples ci-dessus, les sorties POSIX ''stdout'' et ''stderr'' sont sauvegardées dans ces fichiers. | ||
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| + | Ainsi, en exécutant l'exemple ci-dessus, si son numéro de job était le 528491, les fichiers de sortie seraient les suivants : | ||
| + | * ''MyJob.o528491'' pour la sortie standard ''stdout'', l'ensemble des messages du terminal | ||
| + | * ''MyJob.e528491'' pour l'erreur standard ''stderr'', l'ensemble des messages en erreur du terminal | ||
| + | En fouillant dans ces fichiers, il est possible de voir l'évolution de l'exécution de son job et ses erreurs au besoin. | ||