Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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ressources:gridengine4cbp [2017/07/07 17:47] equemene [Introduction] |
ressources:gridengine4cbp [2019/11/05 10:34] equemene [Lancer un calcul autonome (mode batch)] |
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| Les équipements mis à disposition derrière le soumissionneur GridEngine se composent de 84 noeuds dans 4 groupes différents pour un total de 832 coeurs et 2176 Go de RAM. | Les équipements mis à disposition derrière le soumissionneur GridEngine se composent de 84 noeuds dans 4 groupes différents pour un total de 832 coeurs et 2176 Go de RAM. | ||
| - | Sur les 72 noeuds R410 arrivés entre le printemps 2014 et l'automne 2015, tous sont disponibles via le gestionnaire GridEngine. Les noeuds C6100 sont des équipements de prêt connectés un chassis hôte de GPGPU C410X. | + | Sur les 72 noeuds R410 arrivés entre le printemps 2014 et l'automne 2015, tous sont disponibles via le gestionnaire GridEngine. Les noeuds C6100 sont des équipements de prêt connectés un chassis hôte de GPGPU C410X. Les noeuds SL230 sont équipés des processeurs les plus récents du CBP. |
| | **Cluster** | **Marque** | **Modèle** | **Noeuds** | **Coeurs /Noeud** |**RAM /Noeud**|**Réseau GE**|**Réseau IB**|**Total Coeurs**|**Total RAM**| | | **Cluster** | **Marque** | **Modèle** | **Noeuds** | **Coeurs /Noeud** |**RAM /Noeud**|**Réseau GE**|**Réseau IB**|**Total Coeurs**|**Total RAM**| | ||
| - | | **r410ddr** | Dell | R410 | 8 | 8 | 24Go | GE | IB DDR | 64 | 192 Go | | + | | **r410ddr** | Dell | R410 | 8 | 8 | 24 Go | GE | IB DDR | 64 | 192 Go | |
| - | | **r410qdr** | Dell | R410 | 64 | 8 | 24Go | GE | IB QDR | 512 | 1536 Go | | + | | **r410qdr** | Dell | R410 | 64 | 8 | 24 Go | GE | IB QDR | 512 | 1536 Go | |
| - | | **x41z** | Sunfire | x41z | 8 | 8 | 32Go | GE | IB | 64 | 256 Go | | + | | **c61gpu** | Dell | C6100 | 4 | 12 | 48 Go | GE | IB QDR | 48 | 192 Go | |
| - | | **c6100** | Dell | C6100 | 4 | 12 | 48Go | GE | IB | 48 | 192 Go | | + | | **sl230** | HP | SL230 | 8 | 8 | 64 Go | GE | IB FDR | 64 | 512 Go | |
| + | | **x41z** | Sun | x41z | 8 | 8 | 32Go | GE | IB DDR | 64 | 256 Go | | ||
| + | | **x4500** | Sun | x4500 | 4 | 4 | 16Go | GE | IB SDR | 16 | 64 Go | | ||
| + | | **x2200** | Sun | x2200 | 2 | 4 | 32Go | GE | IB DDR | 8 | 64 Go | | ||
| + | | **v20z** | Sun | v20z | 2 | 2 | 16Go | GE | IB SDR | 4 | 32 Go | | ||
| Ces clusters partagent exactement la même image de système, [[developpement:productions:sidus|Sidus]] (pour Single Instance Distributing Universal System), un système complet Debian intégrant tous les paquets scientifiques ainsi que de nombreux paquets de développement. | Ces clusters partagent exactement la même image de système, [[developpement:productions:sidus|Sidus]] (pour Single Instance Distributing Universal System), un système complet Debian intégrant tous les paquets scientifiques ainsi que de nombreux paquets de développement. | ||
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| La commande d'examen des tâches en cours ''qstat'' permet ensuite de savoir que le job a bien été pris en compte. | La commande d'examen des tâches en cours ''qstat'' permet ensuite de savoir que le job a bien été pris en compte. | ||
| + | === Récupérer les informations sur ses jobs exécutés === | ||
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| + | Dans le fichier de batch (celui qui définit les commandes à exécuter avec la queue, l'environnement, etc...) apparait le paramètre préfixé de ''-N''. Ce paramètre est très utile parce que, comme le précise les exemples ci-dessus, les sorties POSIX ''stdout'' et ''stderr'' sont sauvegardées dans ces fichiers. | ||
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| + | Ainsi, en exécutant l'exemple ci-dessus, si son numéro de job était le 528491, les fichiers de sortie seraient les suivants : | ||
| + | * ''MyJob.s528491'' pour la sortie standard ''stdout'', l'ensemble des messages du terminal | ||
| + | * ''MyJob.e528491'' pour l'erreur standard ''stderr'', l'ensemble des messages en erreur du terminal | ||
| + | En fouillant dans ces fichiers, il est possible de voir l'évolution de l'exécution de son job et ses erreurs au besoin. | ||