Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente | Prochaine révision Les deux révisions suivantes | ||
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formation:insa2020gpu:insa2020gromacs4buster [2020/12/06 11:46] equemene [Compilation du programme dans l'environnement du CBP] |
formation:insa2020gpu:insa2020gromacs4buster [2020/12/06 12:23] equemene [Compilation du programme dans l'environnement du CBP] |
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| Ligne 17: | Ligne 17: | ||
| - Définition d'une variable d'environnement pour ce dossier :<code>export GMXINSTALL=$PWD/gromacs-2019.3_install</code> | - Définition d'une variable d'environnement pour ce dossier :<code>export GMXINSTALL=$PWD/gromacs-2019.3_install</code> | ||
| - Déplacement dans le dossier de construction : <code>cd $GMXBUILD</code> | - Déplacement dans le dossier de construction : <code>cd $GMXBUILD</code> | ||
| - | - Construction des tâches de compilation : <code>CC=gcc-7 CXX=g++-7 CPP=cpp-7 cmake $GMXSRC -DGMX_OPENMP=ON -DGMX_GPU=ON -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_PREFER_STATIC_LIBS=ON -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$GMXINSTALL</code> | + | - Définition des outils des compilation : <code>export CC=/usr/bin/gcc-7 |
| + | export CXX=/usr/bin/g++-7 | ||
| + | export CPP=/usr/bin/cpp-7</code> | ||
| + | - Construction des tâches de compilation : <code>cmake $GMXSRC -DGMX_OPENMP=ON -DGMX_GPU=ON -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_MPI=on -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$GMXINSTALL</code> | ||
| - Compilation du programme en mode parallèle : <code>make -j 16 > GMX-Compile-$(date "+%Y%m%d-%H%M") 2>&1</code> | - Compilation du programme en mode parallèle : <code>make -j 16 > GMX-Compile-$(date "+%Y%m%d-%H%M") 2>&1</code> | ||
| - Exécution des tests : <code>make check > GMX-Check-$(date "+%Y%m%d-%H%M") 2>&1 </code> | - Exécution des tests : <code>make check > GMX-Check-$(date "+%Y%m%d-%H%M") 2>&1 </code> | ||