✎ developpement:projets:galaxy[CBP]

✎ developpement:projets:galaxy

Cette page est en lecture seule. Vous pouvez afficher le texte source, mais ne pourrez pas le modifier. Contactez votre administrateur si vous pensez qu'il s'agit d'une erreur.

  * [[developpement:projets|Projets d'infrastructure]]

====== Galaxy Easy Gateway for Biological Laboratories ======
 
{{:recherche:galaxylogotrimmed.png?nolink&200 |}}Partenaires fonctionnels : Sandrine Hugues (IGFL), Marie Sémon (IGFL), Gaël Yvert (LBMC), Floran Chuffart (LBMC), Jeremy Just (RDP), CIRI\\
Maîtrise d'oeuvre : Emmanuel Quemener, CBP, ENS-Lyon

===== Projet =====

Fournir un démonstrateur permettant l'ouverture d'un portail Galaxy à tous les laboratoires de biologie de l'établissement : l'IGFL, le LBMC, le RDP et le CIRI.

Sur ce démonstrateur, il sera évalué les points suivants :
  * la facilité de déploiement du portail Galaxy
  * l'interconnexion du portail Galaxy aux gestionnaires de tâches existants
  * la consolidation de la plate-forme à la charge de plusieurs dizaines d'utilisateurs simultanés
  * la spécialisation de la plate-forme pour des tâches spécifiques expédiées sur des matériels spécifiques
  * la délégation d'installation des greffons Galaxy aux bioinformaticiens

Un premier [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/documents/RapportGalaxy_v1.pdf|rapport]] sur les 6 premiers mois d'exploitation de la plate-forme de test.
===== Pour exploiter la plate-forme =====

Pour disposer d'un accès à la plate-forme, il suffit de :
  - disposer d'un identifiant ENS-Lyon
  - faire connaître cet identifiant à [[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]]
  - intégrer dans son navigateur [[https://igc.services.cnrs.fr/load_all_certificate/?CA=CNRS2-Standard&lang=fr&ca=CNRS2-Standard|l'autorité de certification du CNRS]]
  - se connecter sur [[https://galaxy.cbp.ens-lyon.fr|la plate-forme Galaxy]]

===== Contribution du Centre Blaise Pascal à ce projet =====

Le Centre Blaise Pascal fournit toute l'infrastructure matérielle pour le projet :
  * Machine virtuelle hébergeant le portail Galaxy
  * Passerelle équipée d'un gestionnaire de tâches
  * Noeuds de clusters