Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
developpement:productions:logiciels:aquasol [2013/06/17 06:40] cicaluga [Logiciel AquaSol] |
developpement:productions:logiciels:aquasol [2015/01/07 10:04] |
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- | [[developpement:productions:logiciels|Logiciels]] | ||
- | ====== Logiciel AquaSol ====== | ||
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- | * **Contact** : Ralf Everaers, Cerasela Calugaru, Sam Meyer \\ | ||
- | * **Objectif** : Optimisation (nouveaux algorithmes, parallélisation), implémentation des nouvelles fonctionnalités, validation et tests | ||
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- | Le logiciel AquaSol, (développé par Patrice Koehl & Marc Delarue, [[http://lorentz.immstr.pasteur.fr/aquasol/aquasol_submission.php|AquaSol]]) permet la modélisation de l'environnement ionique autour de biomacromolécules, en utilisant une extension récente de la théorie de Poisson-Boltzmann (modèle Dipolar Poisson-Boltzmann-Langevin). | ||
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- | Nous souhaitons analyser, optimiser et étendre ce code pour l'utiliser à des applications comme les oligomères d'ADN, puis les nucléosomes: | ||
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- | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:validation|Analyse du comportement numérique et informatique du code ]] | ||
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- | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:tests|Tests de performance sur des différentes plateformes]] | ||
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- | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:implementation|Implémentation de nouvelles fonctionnalites]] | ||
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- | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:optimisation|Optimisation des méthodes d’approximation numérique déjà implémentées. Mise en œuvre d’autres méthodes et de nouveaux algorithmes de discrétisation]] |