Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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developpement:productions:logiciels:aquasol [2013/04/17 06:59] cicaluga |
developpement:productions:logiciels:aquasol [2015/01/07 10:04] |
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| - | Le logiciel AquaSol, (développé par Patrice Koehl & Marc Delarue, [[http://lorentz.immstr.pasteur.fr/aquasol/aquasol_submission.php|Aquasol]]) permet la modélisation de l'environnement ionique autour de biomacromolécules, en utilisant une extension récente de la théorie de Poisson-Boltzmann (modèle Dipolar Poisson-Boltzmann-Langevin). | ||
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| - | Nous souhaitons valider, optimiser et étendre ce code pour l'utiliser à des applications comme les oligomères d'ADN, puis les nucléosomes: | ||
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| - | * [[ddeveloppement:productions:logiciels:aquasol|Validation mathématique, numérique et physique]] | ||
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| - | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol|Tests de performance sur des différentes plateformes]] | ||
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| - | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol|Implémentation de nouvelles fonctionnalites]] | ||
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| - | * [[developpement:productions:logiciels:aquasol|Optimisation du code]] : | ||
| - | * * Achever l'implémentation du maillage cartésien non uniforme | ||
| - | * * Utilisation d'un générateur de maillage cartésien non uniforme raffiné autour de la (des) molécule(s) | ||
| - | * * Intégration du solveur MUMPS | ||
| - | * * Parallélisation OpenMP et/ou MPI | ||