✎ developpement:activites:integration:cpmd4jessie[CBP]

✎ developpement:activites:integration:cpmd4jessie

Cette page est en lecture seule. Vous pouvez afficher le texte source, mais ne pourrez pas le modifier. Contactez votre administrateur si vous pensez qu'il s'agit d'une erreur.

  * [[developpement:activites:integration:|Intégration]]

====== Installation de CPMD sous Debian Jessie ======


===== Téléchargement du source =====

Le téléchargement du source exige un identifiant/mot de passe. La dernière version d'archive accessible est la [[http://cpmd.org/downloadable-files/authentication/cpmd-v3_17_1.tar.gz|3.17.1]].

===== Préparation du système =====

<code>
cd /opt
tar xzf /root/cpmd-v3_17_1.tar.gz
mv CPMD CPMD-3.17.1
ln -s CPMD-3.17.1 CPMD


chmod 755 .
</code>

===== Introduction =====


Pour son utilisation, vous pouvez consulter le [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/dokuwiki/doku.php?id=tools4test|"pied à l'étrier"]] rédigé pour les applications scientifiques installées dans le cadre de la formation Atosim.


===== Test des compilations =====

Par défaut, le source de Gaussian comprend les résultats de tests sur architecture AMD64 dans le dossier ''$g09root/g09/tests/amd64''.

Pour exécuter tous les tests, voici la commande <code>
# Creation du dossier pour tous les jobs
mkdir -p /local/$USER/Gaussian/tmp

# A rajouter à la fin de son .bashrc
export g09root=/opt
export GAUSS_SCRDIR=/local/$USER/Gaussian/tmp
. $g09root/g09/bsd/g09.profile
</code>

Lancement de tous les tests :<code>
cd /local/$USER/Gaussian
cp $g09root/g09/tests/com/test*[0-9][0-9].com /local/$USER/Gaussian
for i in $(seq 0 1 1044)
do
  if [ -f test$(printf "%04d" $i).com ]; then
     { /usr/bin/time g09 test$(printf "%04d" $i).com ; } 2> test$(printf "%04d" $i).time
  fi
done
</code>

===== Commandes annexes =====

Pour établir les patchs à appliquer par rapport à l'archive de sources originelle, la commande suivante a été utilisée :<code>diff -crB g09 g09.work > g09.jessie64</code>

 --- //[[emmanuel.quemener@ens-lyon.fr|Emmanuel Quemener]] 2015/03/23 09:50//