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Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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ressources:miniconda4cbp [2022/07/21 13:30] – [Utilisation du miniconda embarqué] equemeneressources:miniconda4cbp [2024/02/16 15:40] (Version actuelle) – [Récupération de l'installeur Miniconda] equemene
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 ===== Utilisation du miniconda embarqué ===== ===== Utilisation du miniconda embarqué =====
  
-Pour exploiter le **miniconda3** version **4.9.2** installé au Centre Blaise Pascal sur les machines du domaine +Pour exploiter le **miniconda3** version **23.3.1** installé au Centre Blaise Pascal sur les machines du domaine 
 [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/python/forms/CloudCBP|CLoudCBP]], il suffit de taper dans un terminal :<code> [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/python/forms/CloudCBP|CLoudCBP]], il suffit de taper dans un terminal :<code>
-module load conda3/4.9.2+module load conda3/23.3.1
 </code> </code>
  
-Ce **miniconda3** comprend notamment les outils suivants :<code> +Ce **miniconda3** comprend notamment les outils classiques de //machine learning// PyTorch et Tensorflow.
-cudnn                     7.6.5                cuda10.1_0    anaconda +
-cupti                     10.1.168                      0    anaconda +
-ninja                     1.11.0               h924138e_0    conda-forge +
-pytorch                   1.7.1           cpu_py39h714fb45_2    conda-forge +
-revbayes                  1.0.13               ha44abe0_2    bioconda +
-scikit-learn              0.23.2           py39hf3c863f_2    conda-forge +
-tensorboard-plugin-wit    1.6.0                      py_0    anaconda +
-tensorflow-metadata       0.14.0             pyhe6710b0_1    anaconda +
-</code>+
 ===== Installation de son propre miniconda ===== ===== Installation de son propre miniconda =====
  
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 Pour récupérer le dernier installeur Miniconda pour **Python 3.9**, tapez les commandes suivantes :<code> Pour récupérer le dernier installeur Miniconda pour **Python 3.9**, tapez les commandes suivantes :<code>
 cd $HOME cd $HOME
-wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh +wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O $HOME/Miniconda.sh
-mv Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh Miniconda3.sh+
 </code> </code>
  
Ligne 57: Ligne 47:
     * vous pouvez spécifier un autre endroit comme, par exemple dans l'espace //projets// ''projects''     * vous pouvez spécifier un autre endroit comme, par exemple dans l'espace //projets// ''projects''
       * pour vous en particulier : ''/projects/users/$USER/Miniconda3''       * pour vous en particulier : ''/projects/users/$USER/Miniconda3''
-      * pour un projet en particulier : ''/projects/<MonProjet>Miniconda3''+      * pour un projet en particulier : ''/projects/<MonProjet>/Miniconda3''
   - modification de la configuration du shell : tapez ''yes'' à l'invite python <code>Do you wish the installer to initialize Miniconda3   - modification de la configuration du shell : tapez ''yes'' à l'invite python <code>Do you wish the installer to initialize Miniconda3
 by running conda init? [yes|no] by running conda init? [yes|no]
 </code> </code>
 +<hidden>Section masquée</hidden>
 Par défaut, la configuration de votre shell est modifiée : à chaque ouverture de terminal, l'environnement **Conda** sera chargé, ce qui peut poser des difficultés si vous travaillez avec plusieurs environnements. Par défaut, la configuration de votre shell est modifiée : à chaque ouverture de terminal, l'environnement **Conda** sera chargé, ce qui peut poser des difficultés si vous travaillez avec plusieurs environnements.
  
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 cp $HOME/.bashrc.orig $HOME/.bashrc cp $HOME/.bashrc.orig $HOME/.bashrc
 </code> </code>
 +
 +<note warning>Attention ! Avant d'installer un environnement **conda** dans un dossier dans ''/projects'', ''/scratch'' ou ''/local'', assurez-vous de créer **d'abord** le dossier avec ''mkdir /projects/users/$USER'', ''mkdir /scratch/$USER'' ou ''mkdir /local/$USER''</note>
  
 ==== Lancement de l'environnement Conda installé ==== ==== Lancement de l'environnement Conda installé ====
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   * ''/scratch/jmylq/miniconda3/condabin''   * ''/scratch/jmylq/miniconda3/condabin''
  
-==== Installation d'un logiciel dans l'environnement Conda installée ====+==== Installation d'un logiciel dans l'environnement Conda configuré ====
  
 Une fois l'environnement chargé avec ''source $HOME/CondaLatest.rc'', il suffit de taper ''conda install <Logiciel>'' pour que **Conda** recherche les dépendances, les installe puis installe le logiciel spécifié. Une fois l'environnement chargé avec ''source $HOME/CondaLatest.rc'', il suffit de taper ''conda install <Logiciel>'' pour que **Conda** recherche les dépendances, les installe puis installe le logiciel spécifié.
ressources/miniconda4cbp.1658410208.txt.gz · Dernière modification : (modification externe)