Intégration de MAGMA sur Debian Wheezy

La librairie MAGMA permet l'exploitation de cartes accélératrices (GPU à base de Nvidia Cuda, Xeon Phi et AMD/ATI) pour réaliser les opérations essentielles proposées dans les librairies Lapack.

Aucune version n'est pour l'instant disponible dans la Debian Wheezy, aucune non plus dans la Sid et dans les archives expérimentales. Aucun ITP non plus n'a été déposé pour cette librairie.

apt-get -y install libatlas3-base libatlas-base-dev libatlas-dev

apt-get -y install libcublas*

# Declaration des variables
export ATLASDIR=/usr/lib/atlas-base
export LAPACKDIR=/usr/lib/atlas-base/atlas

Pour les librairies CUDA, c'est un peu plus compliqué : les paquets Debian Experimental

ln -s /usr/share/doc/nvidia-cuda-doc/examples /usr/lib/nvidia-cuda-toolkit/src
export CUDADIR=/usr/lib/nvidia-cuda-toolkit

Dans un environnement SIDUS (en chroot sur un dossier particulier), il est nécessaire de monter le /proc pour compiler la librairie

mount -t proc none /proc

cd /root
wget http://icl.cs.utk.edu/projectsfiles/magma/downloads/magma-1.4.1.tar.gz

cd /opt
tar xzf /root/magma-1.4.1.tar.gz
cd /opt/magma-1.4.1

cp make.inc.atlas make.inc
sed -i "s/\ \-lifcore//g" make.inc
sed -i "s/\-O3/\-fPIC \-O3/g" make.inc
sed -i "s/\-fopenmp/\-fPIC \-fopenmp/g" make.inc
sed -i "s/NVOPTS\ \ \ \ \=\ \-fPIC/NVOPTS\ \ \ \ \=\ /g" make.inc
sed -i "s/\-fno-strict-aliasing/-fPIC/g" make.inc
sed -i "s/\-L\$(ATLASDIR)\/lib/\-L\$(ATLASDIR)/g" make.inc

make
make shared

cd /opt
[ -h /opt/magma ] && rm /opt/magma
ln -s magma-1.4.1 magma
echo /opt/magma/lib >> /etc/ld.so.conf.d/magma.conf
ldconfig

umount /proc

Compilation des tests

cd /opt/magma/testing
make

Exécution des tests

cd /opt/magma/testing
find . -name "testing*" -executable -print | sort | while read PRG; do $PRG; done

— Emmanuel Quemener 2014/01/16 10:26