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Utilisation Hoomd

La version de Hoomd installée est la 2.6.0

Deux versions ont été compilées :

  • celle pour des calculs en simple précision, FP32, (les outils HPMC sont exclus)
  • celle pour des calculs en double précision, FP64, complète.

Pour l'utiliser

  • En commande en ligne, dans un terminal :
    • module load hoomd/2.6.0-FP32 pour utiliser Hoomd en simple précision
    • module load hoomd/2.6.0-FP64 pour utiliser Hoomd en double précision

Exemple d'utilisation

Cet ensemble de commandes permet l'execution d'un des exemples de benchmarks de HOOMD

# chargement du module permettant l'exploitation du logiciel
module load hoomd/2.6.0-FP64
# creation du dossier dans un espace temporaire
mkdir -p /local/$USER && cd /local/$USER
# recuperation de l'ensemble des benckmarks par GIT
git clone https://github.com/joaander/hoomd-benchmarks.git
# passage dans un des dossiers de benckmark
cd hoomd-benchmarks/microsphere
# execution du benckmark
python3 bmark.py

La sortie exécutée sur une machine équipée d'une GTX 780 (une carte relativement ancienne) est :



ressources/ressources/hoomd.1562946239.txt.gz · Dernière modification: 2019/07/12 17:43 par equemene