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recherche:projets:biologiecel [2014/06/03 15:53]
cicaluga [Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images]
recherche:projets:biologiecel [2017/06/14 20:31]
cicaluga [Contribution of CBP]
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 ===== Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images ===== ===== Développement d’une bibliothèque parallèle dans le domaine de la biologie cellulaire et du traitement d’images =====
  
-{{:​formation:​stages:​stage_rdp.png?​nolink&​200 |}}Coordination : Cerasela Calugaru et Annamaria Kiss\\ \\+{{:​formation:​stages:​stage_rdp.png?​nolink&​200 |}}Coordination : Cerasela Calugaru et Annamaria Kiss\\
 Etudiante stagiaire : Typhaine Moreau Etudiante stagiaire : Typhaine Moreau
  \\ \\  \\ \\
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   * implement the method in C++, using the optimal parallelizing technique   * implement the method in C++, using the optimal parallelizing technique
   * deliver the implementation as a plugin to existing computing platforms   * deliver the implementation as a plugin to existing computing platforms
 +
 +  * [[developpement:​productions:​logiciels:​LevelSetMethod|Level Set Method]]
 +  * [[developpement:​productions:​logiciels:​AnisotropicBlur|Anisotropic Blur]] ​
 ====== Contribution of CBP ====== ====== Contribution of CBP ======
  
   * Etude du code d’origine (écrit en Python), et une évaluation préliminaire du coût de la réécriture du code en C++, de son optimisation et parallélisation ​   * Etude du code d’origine (écrit en Python), et une évaluation préliminaire du coût de la réécriture du code en C++, de son optimisation et parallélisation ​
 +  * Adaptation du code pour permettre la prise en compte du format de fichier .tif
 +  * Expertise et adaptation du code pour utilisation sur de différents plateformes et architectures
   * Expertise au choix des méthodes numériques,​ programmation dans le cadre du projet   * Expertise au choix des méthodes numériques,​ programmation dans le cadre du projet
 +  * Formation et soutien à la parallélisation avec OpenMP de codes des calcul développés ​
 +  * Utilisation des ressources logistiques et informatiques (bureau, salle de réunion, salle des terminaux, etc.)
 +  * Expertise au choix de la licence pour le nouveau logiciel écrit dans le cadre du projet
 +  * Adaptation du code pour permettre des options supplémentaires ​
 +  * Corrections de bogues pour améliorer la fiabilité du programme dans certains cas test
 +  * Nous sommes très reconnaissants pour les ressources informatiques fournis par le PSMN.
recherche/projets/biologiecel.txt · Dernière modification: 2018/06/19 10:07 par cicaluga