Stockage Informatique pour les laboratoires du site Monod
Traitements : Définitions
Quel est le nom de la plate-forme de traitement ?
Pourquoi ?
Quelle la fonction de cette plate-forme ? Exemple : Cette plate-forme de traitement est destinée au traitement d'images issues de caméra d'acquisition.
Quoi ?
Quelle est la nature du traitement ?
Exemple : Le traitement est une déconvolution des images issues d'une séquence vidéo par une PSF
Entrée : Quelle est la nature des fichiers en entrée ?
Exemple : Une séquence vidéo au format MJPeg d'un format 1024² à 25 Hz et une réponse impulsionnelle de l'instrument de format 1024² au format Tiff
Sortie : Quelle est la nature de la sortie ?
Exemple : Un ensemble d'images au format Tiff
Qui ?
Quel est l'opérateur et pour qui réalise-t-il les expériences ? Cette information est importante pour déterminer comment la donnée doit être intégrée à l'infrastructure de stockage (question d'authentification et de droits d'accès).
Par qui ? Quelle personne lance le traitement ?
Exemple : Un doctorant télécharge les données sur une station de travail et lance le travail.
Pour qui ? Quelle personne exploite les résultats ?
Exemple : Idem que le “par qui”.
Quand ?
Quelle est l'utilisation de la plate-forme ?
Durée : Quelle est la durée moyenne d'un traitement ?
Exemple : Le traitement d'une séquence de 10 minutes (15000 images) dure 1 heure
Récurrence : Combien de traitements sont-ils réalisés par semaine ?
Exemple : La plate-forme numérique est utilisée en moyenne 2 fois par semaine (contrainte de débit !)
Pérennité : Quelle durée de vie donner aux données traitées ?
Exemple : Les données brutes sont conservées aussi longtemps que possible.
Où ?
Où se situent les équipements utilisés pendant le traitement ?
Source : Où se trouvent les données sources, les paramétrages de traitement ?
Exemple : Les données sources se trouvent dans un répertoire distant.
Équipement : Dans quel local se trouve l'expérience (contrainte d'accès) ?
Exemple : Dans une salle d'accès libre, avec une authentification sur le poste.
Destination : Les résultats d'une expérience sont-ils stockés localement ?
Exemple : Les résultats sont stockés en local. Ils sont ensuite copiés manuellement sur un répertoire distant.
Combien ?
Volume : Quel est le volume de données (en Mo) d'un traitement ?
Exemple : Un traitement génère un volume de données 20x supérieur au volume initial (images de JPeg en Tiff). Pour 10 minutes, les données passent de 1,8 Go à 36 Go.
Débit : Le réseau standard (100Mbits/s) est-il suffisant pour les transferts ?
Exemple : Non ! Le transfert initial avant traitement dure environ 10 minutes, le transfert final près de 4 heures.
Latence : Existe-t-il des contraintes sur les outils pour une acquisition ?
Exemple : Oui. L'utilisation d'un partage réseau pour les données en entrée est inadaptée pour des raisons d'accès direct aux données.
Comment ?
Logiciels : Quel type de logiciel est utilisé pour le traitement ?
Exemple : Le logiciel est un programme en C utilisant les librairies FFTW pour le traitement et FFmpeg pour la segmentation des vidéos.
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