Galaxy Easy Gateway for Biological Laboratories

Partenaires fonctionnels : Sandrine Hugues (IGFL), Marie Sémon (IGFL), Gaël Yvert (LBMC), Floran Chuffart (LBMC), Jeremy Just (RDP), CIRI
Maîtrise d'oeuvre : Emmanuel Quemener, CBP, ENS-Lyon

Fournir un démonstrateur permettant l'ouverture d'un portail Galaxy à tous les laboratoires de biologie de l'établissement : l'IGFL, le LBMC, le RDP et le CIRI.

Sur ce démonstrateur, il sera évalué les points suivants :

• la facilité de déploiement du portail Galaxy
• l'interconnexion du portail Galaxy aux gestionnaires de tâches existants
• la consolidation de la plate-forme à la charge de plusieurs dizaines d'utilisateurs simultanés
• la spécialisation de la plate-forme pour des tâches spécifiques expédiées sur des matériels spécifiques
• la délégation d'installation des greffons Galaxy aux bioinformaticiens

Un premier rapport sur les 6 premiers mois d'exploitation de la plate-forme de test.

Pour disposer d'un accès à la plate-forme, il suffit de :

1. disposer d'un identifiant ENS-Lyon
2. demander à son référent Galaxy de laboratoire de contacter le CBP pour l'autorisation d'accès :
   • Sandrine Hughes pour l'IGFL
   • Laurent Modolo pour le LBMC
   • Jeremy Just pour le RDP
3. intégrer dans son navigateur l'autorité de certification du CNRS
4. se connecter sur la plate-forme Galaxy

Le Centre Blaise Pascal fournit toute l'infrastructure matérielle pour le projet :

• Machine virtuelle hébergeant le portail Galaxy
• Passerelle équipée d'un gestionnaire de tâches
• Noeuds de clusters