Ceci est une ancienne révision du document !
Intégration de DNABend sur une Debian Wheezy
Il n'existe aucune version de DNABend dans la Debian, ni dans Squeeze, ni même dans Sid.
Compilation de l'application
Installation des prérequis
Comme nous allons le découvrir à la compilation, DNABend, dans sa version “standard”, ne compile qu'avec la version la plus vieille de G++ intégrée dans la Debian Wheezy, la version 4.4. Il existe également une forte dépendance à GSL
Récupération des sources
Le téléchargement du code suppose l'acceptation de la licence académique associée.
cd /root wget http://nucleosome.rutgers.edu/nucleosome/DNABEND_1.1.tgz
Expansion de l'archive
cd /opt tar xzf cd
Compilation
- modification du
Makefile- compilateur g++-4.4 indispensable
- modification de
dna_parameters.h- changement de <string> en <string.h>
Installation
Exécution des tests
— Emmanuel Quemener 2013/06/09 21:44
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