developpement:activites:integration:dnabend4wheezy

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement:activites:integration:dnabend4wheezy [2013/06/10 10:37]
equemene [Installation des prérequis]
+++ developpement:activites:integration:dnabend4wheezy [2015/01/07 10:04] (Version actuelle)
@@ Ligne 12: / Ligne 12: @@
 <code>
+apt-get install libc6 libc6-i386 libgcc1 libgsl0ldbl libstdc++6 g++-4.4 libgsl0-dev libstdc++6-4.4-dev
 </code>
+La commande pour récupérer les dépendances en librairies utilisées est : <code>
+ldd ../bin/esolve | awk '{ print $1 }' | xargs -I '{}' dpkg -S '{}' | awk -F':' '{ print $1 }' | sort -u | tr '\n' ' '
+</code>
 ==== Récupération des sources ====
@@ Ligne 21: / Ligne 24: @@
 <code>
 cd /root
-wget
+wget http://nucleosome.rutgers.edu/nucleosome/DNABEND_1.1.tgz
 </code>
@@ Ligne 28: / Ligne 31: @@
 <code>
 cd /opt
-tar xzf
+tar xzf /root/DNABEND_1.1.tgz
-cd
 </code>
-==== Compilation ====
+==== Modification des sources ====
-  * modification du ''Makefile''
+<code>
-    * compilateur g++-4.4 indispensable
+mv /opt/DNABEND_1.1/source/Makefile /opt/DNABEND_1.1/source/Makefile.orig
-    *
+wget -O /opt/DNABEND_1.1/source/Makefile http://www.cbp.ens-lyon.fr/software/DNABEND/Makefile.DNABEND
-  * modification de ''dna_parameters.h''
+sed -i 's/<string>/<string.h>/g' /opt/DNABEND_1.1/include/dna_parameters.h
-    * changement de <string> en <string.h>
+</code>
+==== Compilation ====
-==== Installation ====
 <code>
+cd /opt/DNABEND_1.1/source
+make clean
+make esolve
+make edesign
 </code>
+Les exécutables se trouvent dans ''/opt/DNABEND_1.1'' : ''edesign'' et ''esolve''.
 ===== Exécution des tests =====

developpement/activites/integration/dnabend4wheezy.1370853441.txt.gz · Dernière modification: 2015/01/07 10:04 (modification externe)

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