====== Nvidia-Docker ======

L'environnement [[https://www.docker.com/|Docker]] a été installé au printemps 2018 sur les postes SIDUS du CBP pour offrir un système de déploiement simplifié de Workflow pour les laboratoires de biologie.

L'environnement [[https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker|Nvidia-Docker]] permet d'exploiter le GPU de l'hôte pour lancer ses propres systèmes d'exploitations déployés dans un environnement Docker.

Pour l'exploiter sur une machine équipée d'un GPU Nvidia, la création d'un environnement <code>
docker run -it --runtime=nvidia --rm nvidia/cuda</code>

Lors du premier lancement (si le conteneur n'est pas disponible), il le télécharge<code>
Unable to find image 'nvidia/cuda:latest' locally
latest: Pulling from nvidia/cuda
8ee29e426c26: Pull complete 
6e83b260b73b: Pull complete 
e26b65fd1143: Pull complete 
40dca07f8222: Pull complete 
b420ae9e10b3: Pull complete 
a579c1327556: Pull complete 
b440bb8df79e: Pull complete 
de3b2ccf9562: Pull complete 
a69a544d350e: Pull complete 
02348b5db71c: Pull complete 
Digest: sha256:5996fa2fc0666972360502fe32118286177b879a8a1a834a176e7786021b8cee
Status: Downloaded newer image for nvidia/cuda:latest</code>

Une fois le conteneur téléchargé, installé et lancé, l'invite de commandes :<code>
root@7340be350b1e:/# </code>

Pour vérifier que l'image contient bien le support GPU sous Nvidia, lancement de la commande ''nvidia-smi'' : <code>
Tue Aug 21 14:32:22 2018       
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 384.130                Driver Version: 384.130                   |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  Quadro K420         Off  | 00000000:3B:00.0  On |                  N/A |
| 26%   52C    P8    N/A /  N/A |     52MiB /  1998MiB |      0%      Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
|   1  GeForce GTX 108...  Off  | 00000000:3C:00.0 Off |                  N/A |
| 23%   40C    P8    19W / 250W |      2MiB / 11172MiB |      0%      Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
                                                                               
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                       GPU Memory |
|  GPU       PID   Type   Process name                             Usage      |
|=============================================================================|
+-----------------------------------------------------------------------------+
</code>