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====== ANR FSCF ======

{{:science:projets:proteins.png?nolink&250 |}}**Fluctuations in Structured Coulomb Fluids** 

Partenaires : 
  * Ralf Everaers, Centre Blaise Pascal, ENS de Lyon, France
  * Ralf Blossey, IRI - Institut de Recherche Interdisciplinaire de Lille, France
  * Anthony Maggs, Laboratoire de Physico-Chime Théorique, ESPCI, France
  * Henri Orland, Institut de Physique Théorique, CEA-Saclay, France
Staff :
  * Cerasela Calugaru, Centre Blaise Pascal, ENS de Lyon, France
  * Sam Meyer (Postdoc 2012-2013), Centre Blaise Pascal, ENS de Lyon, France

===== Projet =====

The aim of the project is to theoretically model the effects of fluctuations in Structured Coulomb
fluids (SCF’s) and to develop the computational means to apply implicit solvent models to
biological systems. 

SCF’s are composed of solvated ions, charged molecules like DNA, proteins or protein
complexes, or larger biomolecular structures such as membranes. Since often such biological
systems are highly charged, both fluctuations of the electrostatic potential or electric field
and the nature of the polarizable surrounding medium, water, need to be taken into account
in order to describe these systems in a proper way.

In the first part of the project we will extend an established generalization of the mean-field
Poisson-Boltzmann theory of SCF’s based on the electrostatic potential to include
fluctuations. The second part of the project will see the development a Poisson-Boltzmann
theory for an SCF in terms of a local constrained functional of the electric field, which due to its
convexity property has an essential computational advantage and will allow applications of
our approach to still larger systems.

===== Contribution du Centre Blaise Pascal à ce projet =====

  * Installation, support à l'utilisation (au PSMN, à ECL),
  * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:validation|Analyse du comportement numérique et informatique du code ]],
  * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:implementation|Implémentation de nouvelles fonctionnalites]],
  * [[developpement:productions:logiciels:aquasol:optimisation|Optimisation des méthodes d’approximation numérique déjà implémentées. Mise en œuvre d’autres méthodes et de nouveaux algorithmes de discrétisation]] ,
  * Conduite des expériences numériques pour tester la configuration Yakuva (positions des ions, conditions limites, distribution de charges, en l’absence/la présence du solvant) sur les différents modèles PB
  * Mise au point de configurations fonctionnant pour les cas AGTC avec le modèle Yukawa
  * Présentation dans des journées de travail, rédaction de support de travail scientifique, participation à la rédaction des articles, etc.