* [[developpement:projets|Projets d'infrastructure]] ====== Galaxy Easy Gateway for Biological Laboratories ====== {{:recherche:galaxylogotrimmed.png?nolink&200 |}}Partenaires fonctionnels : Sandrine Hugues (IGFL), Marie Sémon (IGFL), Gaël Yvert (LBMC), Floran Chuffart (LBMC), Jeremy Just (RDP), CIRI\\ Maîtrise d'oeuvre : Emmanuel Quemener, CBP, ENS-Lyon ===== Projet ===== Fournir un démonstrateur permettant l'ouverture d'un portail Galaxy à tous les laboratoires de biologie de l'établissement : l'IGFL, le LBMC, le RDP et le CIRI. Sur ce démonstrateur, il sera évalué les points suivants : * la facilité de déploiement du portail Galaxy * l'interconnexion du portail Galaxy aux gestionnaires de tâches existants * la consolidation de la plate-forme à la charge de plusieurs dizaines d'utilisateurs simultanés * la spécialisation de la plate-forme pour des tâches spécifiques expédiées sur des matériels spécifiques * la délégation d'installation des greffons Galaxy aux bioinformaticiens Un premier [[http://www.cbp.ens-lyon.fr/emmanuel.quemener/documents/RapportGalaxy_v1.pdf|rapport]] sur les 6 premiers mois d'exploitation de la plate-forme de test. ===== Pour exploiter la plate-forme ===== Pour disposer d'un accès à la plate-forme, il suffit de : - disposer d'un identifiant ENS-Lyon - demander à son référent Galaxy de laboratoire de contacter le CBP pour l'autorisation d'accès : * Sandrine Hughes pour l'IGFL * Laurent Modolo pour le LBMC * Jeremy Just pour le RDP - intégrer dans son navigateur [[https://igc.services.cnrs.fr/load_all_certificate/?CA=CNRS2-Standard&lang=fr&ca=CNRS2-Standard|l'autorité de certification du CNRS]] - se connecter sur [[https://galaxy2.cbp.ens-lyon.fr|la plate-forme Galaxy]] ===== Contribution du Centre Blaise Pascal à ce projet ===== Le Centre Blaise Pascal fournit toute l'infrastructure matérielle pour le projet : * Machine virtuelle hébergeant le portail Galaxy * Passerelle équipée d'un gestionnaire de tâches * Noeuds de clusters